Louping ill virus(LIV) присутствует на Британских островах. LIV вызывает лихорадочное заболевание у овец, крупного рогатого скота, куропаток и некоторых других видов, которые могут прогрессировать до смертельного энцефалита. Заболевание выявляется преимущественно у животных из нагорных районов Великобритании и Ирландии. Вирус принадлежит к роду флавивирусов и проявляет высокую степень генетической гомологии к ВКЭ и других клещевых вирусов млекопитающих. В дополнение острый энцефаломиелит вызванный у овец распростроняется и на других млекопитающих, некоторых видов птиц и людей, особенно тех, чья профессия предполагает контакт с овцами. Профилактическая вакцинация овец является эффективной, хотя нет никакого лечения заболевания. [1] Вирус клещевого энцефалита (Шотландский энцефаломиелит или вертячка овец) - острая вирусная болезнь, характеризующаяся поражением центральной нервной системы и явлениями мозжечковой атаксии. Английское название болезни Louping ill, связано со старым норвежским словом hlaupa, означающим движение вперед вприпрыжку или спотыкаясь. Болезнь известна в Шотландии с конца XVIII века, а в конце прошлого века было отмечено, что ее появление связано с обнаружением клещей на пастбищах. Вирусную природу болезни доказали Пул, Броунли и Вильсон (W. A. Pool, A. Broun-lee, R. D. Wilson) в 1930 г.[2] Возбудитель - нейротропный вирус группы В арбовирусов (вирусы комплекса клещевого энцефалита). Размеры вируса 15-27 ммк. Он проходит через свечи Шам-берлана L3 и Беркефельда V.
Таблица 1. Основные параметры генома вируса Louping ill virus.
Параметр | Значение |
Английское (или латинское) название вируса | Louping ill virus |
Русское название вируса | вирус клещевого энцефалита |
Количество фрагментов в полном геноме | 1 |
Общая длина генома (п.н.) | 10861 |
Количество кодируемых в геноме полипептидов | 1 |
Количество "зрелых" вирусных белков | 12 |
>gi|9629457|ref|NP_044677.1| polyprotein [Louping ill virus] MGRKTILKGKGGGPPRRVSKETATKTRQSRVQMPNGLVLMRMMGILWHAVAGTARNPVLKAFWNSVPLRQ ATAALRKIKRTVSALMVGLQRRGKRRSVTNWMNWLLVIALLGMTLAATVRKEGDGTTVIRAEGRDAATQV RVENGTCVILATDMGSWCDDSLSYECVTIEQGEEPVDVDCFCRNVDGVYLEYGRCGKQEGSRTRRSVLIP THAQGELTGRGRKWLEGDSLRTHLTRVEGWVWKNKLLALAMVAVVWLALESVVTRVAVLVVLLCLAPVYA SRCTHLENRDFVTGTQGTTRVTLVLELGGCVTITAEGKPSMDVWLDAIYQESPAKTREYCLHAKLSETKV AARCPTMGPAVLTEERQIGTVCKRDQSDRGWGNHCGLFGKGSIVACVKAACEAKKKATGYVYDANKIVYT VKVEPHTGDYVAANETHKGRKTATFTVSSEKTILTLGEYGDVSLLCRVASGVDLAQTIILELDKTAEHLP TAWQVHRDWFNDLALPWKHDGNPHWNNAERLVEFGAPHAVKMDVYNLGDQTGVLLRALAGVPVAHIEGNK YHLKSGHVTCEVGLEKLKMKGLTYTMCDKSKFAWKRTPTDSGHDTVVMEVTFSGSKPCRIPVRAVAHGSP DVNVAMLITPNPTIENDGGGFIEMQLPPGDNIIYVGELSHQWFQTGSSIGRVFQTTRKGIERLTVIGEHA WDFGSAGGFFGSIGKAVHTVLGGAFNSIFGGVGFLPKLLMGVALAWLGLNTRNPTMSMSFLLAGGLVLAM TLGVGADVGCAVDTERMELRCGEGLVVWREVSEWYDNYAYYPETPGALASAVKEAFEEGSCGVVPQNRLE MAMWRSSVTELNLALVEGDANLTVVVDKNDPTDYRGGVPGTLKKGKDMKVSWRSWGHSMIWSIPEAPRRF MVGTEGQSECPLERRKTGVFTVAEFGVGLRTKVFLDFRQEPTHECDTGVMGAAVKNDMAVHTDQSLWMKS MRNDTGTYIVELLVTDLRNCSWPASHTIDNADVVNSELFLPASLRGPRSWYNRIPGYSEQVKGPWKHTPL RVIREECPGTTVTINAKCEKRGASVRSTTESGKVIPEWCCRACTMPPVTFRTGTDCWYAMEIRPVHAQGG LVRSMVVADNGELLSEGGVPGIVALFVVLECIIRRRPSTGVTVVWGGVVVLALLVTGMVRIESLVRYVVA VGIAFHLELGPETVALMLLQAVFELRVGLLSAFALRRGLTVREMVTTYFLLLVLELGLSSAGLGDLWKWS DALAMGALIFRACTAEGKTGTGLLLIALMTQRDVVTVHHGLVCFLAAAAACSVWRLLRGHREQKGLTWII PLARLLGGEGSVIRLLAFWELAAHRGRRSFSEPLTVVVVMLTLASGMMRHTSQEALCALAVASFFLLMLV SGTRKMQLVAEWSGCVEWHPETVNEGGEISLRVRQDSMGNFHLTELEKEERMMAFWLLAGLVASALHWSG ILGVMGLWTLTEIMRSSRRSDLVYSGQGGQERGDRPFEVKDGVYRIFSPGLFWGQRQVGVGYGHKGVLHT MWHVTRGAALSIDDAVAGPYWADVKEDVVCYGGAWSLEEKWKGETVQVHAFPPGRAHEVHQCQPGELILD TGKRLGAIPIDLAKGTSGSPILNAQGVVVGLYGNGPKTNESYVSSIAQGEAEKSRPNLPQAVVGTGWTSK GQITVLDMHPGSGKTHRVLPELIRQCIDRRLSTLVLAPTRVVLKEMERALSGKRVRFHSPAVSDQQAGGA IVDVMCHATYVNRRLLPQGRQNWEVAIMDEAHWTDPHSIAARGHLYTLAKENKCALVLMTATPPGKSEPF PESNGAITSEERQIPDGEWRDGFDWITEYEGRTAWFVPSIAKGGVIARTLRQKGKSVICLNSKTFEKDYS RVREEKPDFVVTTDISEMGANLDVSRVIDGRTNIKPEEVDGKVELTGTRRVTTASAAQRRGRVGRQDGRT DEYIYSGQCDDDDSGLVQWKEAQILLDNITTLRGPVATFYGPEQDKMPEVAGHFRLTEEKRKHFRHLLTH CDFTPWLAWHVAANVSSVTDRSWTWEGPEANAVDEASGDLVTFRSPNGAERTLRPVWRDARMFREGRDIK EFVAYASGRRSFGDVLTGMSGVPELLRHRCVNALDVFYTLMHEEPGSRAMKMAERDAPEAFLTVVEMMVL GLATLGVVWCFVVRTSISRMMLGTLVLLASLLLLWAGGVGYGNMAGVALIFYTLLTVLQPETGKQRSSDD NKLAYFLLTLCSLAGLVAANEMGFLEKTKADLSAMLWSGHEEHRQWSEWTNVDIQPARSWGTYVLVVSLF TPYIIHQLQTKIQQLVNSAVASGAQAMRDLGGGAPFFGVAGHVMTLGVVSLVGATPTSLIVGIGLAAFHL AIVVSGLEAELTQRAHKVFFSAMVRNPMVDGDVINPFGEGEAKPALYERKMSLVLAIVLCLVSVVMNRTV ASMTEAAAVGLAATGQLLRPEADTLWTMPVACGMSGVVRGSLWGFLPLGHRLWLRASGGRRGGSDGDTLG DLWKRRLNNCTKEEFFVYRRTGILETERDKARELLRRGETNMGLAVSRGTAKLAWLEERGYRTLKGEVVD LGCGRGGWSYYAASRPAVMSVRAYTIGGRGHEVPKMVTSLGWNLIRFRSGMDVFSMQPHRADTIMCDIGE SNPDAAVEGERTRKVISLMEQWKIRNPAAACVFKVLAPYRPEVIEALHRFQLQWGGGLVRTPFSRNSTHE MYYSTAVTGNIVNSVNIQSRKLLARFGDQRGPTKVPEADLGVGTRCVVLAEDKVKEQDVQERIRALRKQY SETWHMDEEHPYRTWQYWGTSRTAPTGSAASLINGVVKLLSWPWNAREDVVRMAMTDTTAFGQQRVFKEK VDTKAQEPQPGTRVITRAVNDWILERLAQKSKPRMCSREEFIAKVRSNAALGAWSDEQNRWASAREAVVV PAFWALVDEVRERHLVGWCAHCVYIMMGMREKKLGEFGVAKGSRAIWYMWLGSRFLEFEALGFLNKDHWA SRESSGGGVEGISLNYLGWHLKKLTTLNGGLFYADDTAGWDTKGTNSDPEDEEQILRYMEGEHKQLATTI MQKAYHAKVVKVARPSRDGGCIMDVITRRDQRGSGQVVTYALNTLTNIKVQSTRMMEGEGVIEAEDAHNP RLLRVERWLKEHGEERLGRMLVSGDDCVVRPIDDRFGKALYFLNDMAKTRKDMGEWEPSAGFSSWEEVPF CSHHFHELVMKDGRTLVVPCRDQDELVGRARVSPGCGWSVRETACLSKAYGQMWLLSYFHRRDLRTLGFA ISPAVPVDWVPTGRTTWSIHASGAWMTTEDMLDVWNRVWILDNPFMQNKERIMEWRDVPYLPKTQDMICS SLVGRKERAEWAKNIWGAVEKVRKMIGPERFKDYLSCMDRHDLHWELKLESSII |