Краткое описание вируса Louping ill virus


     
    
   Louping ill virus(LIV) присутствует на Британских островах. LIV вызывает лихорадочное заболевание у овец, крупного рогатого скота,                                              
   куропаток и некоторых других видов, которые могут прогрессировать до смертельного энцефалита. Заболевание                                                                       
   выявляется преимущественно у животных из нагорных районов Великобритании и Ирландии. Вирус принадлежит к роду флавивирусов и проявляет высокую                                  
   степень генетической гомологии к ВКЭ и других клещевых вирусов млекопитающих. В дополнение острый энцефаломиелит вызванный у овец распростроняется и на других млекопитающих,   
   некоторых видов птиц и людей, особенно тех, чья профессия предполагает контакт с овцами. Профилактическая вакцинация овец является эффективной,                                 
   хотя нет никакого лечения заболевания.  [1]                                                                                                                                            
                                                                                                                                                                                       
                                                                                                                                                                                       
   Вирус клещевого энцефалита (Шотландский энцефаломиелит или вертячка овец) - острая вирусная болезнь,
   характеризующаяся поражением центральной нервной системы и явлениями мозжечковой атаксии.
   Английское название болезни Louping ill, связано со старым норвежским словом hlaupa, означающим движение вперед вприпрыжку или спотыкаясь.
   Болезнь известна в Шотландии с конца XVIII века, а в конце прошлого века было отмечено, что ее появление связано
   с обнаружением клещей на пастбищах. Вирусную природу болезни доказали Пул, Броунли и Вильсон (W. A. Pool, A. Broun-lee, R. D. Wilson) в 1930 г.[2]
         
   Возбудитель - нейротропный вирус группы В арбовирусов (вирусы комплекса клещевого энцефалита).
   Размеры вируса 15-27 ммк. Он проходит через свечи Шам-берлана L3 и Беркефельда V.

  

Таблица 1. Основные параметры генома вируса Louping ill virus.

Параметр Значение
Английское (или латинское) название вируса Louping ill virus
Русское название вируса вирус клещевого энцефалита
Количество фрагментов в полном геноме 1
Общая длина генома (п.н.) 10861
Количество кодируемых в геноме полипептидов 1
Количество "зрелых" вирусных белков 12

Здесь содержится аминокислотная последовательность самого короткого белка вируса

>gi|9629457|ref|NP_044677.1| polyprotein [Louping ill virus]
MGRKTILKGKGGGPPRRVSKETATKTRQSRVQMPNGLVLMRMMGILWHAVAGTARNPVLKAFWNSVPLRQ
ATAALRKIKRTVSALMVGLQRRGKRRSVTNWMNWLLVIALLGMTLAATVRKEGDGTTVIRAEGRDAATQV
RVENGTCVILATDMGSWCDDSLSYECVTIEQGEEPVDVDCFCRNVDGVYLEYGRCGKQEGSRTRRSVLIP
THAQGELTGRGRKWLEGDSLRTHLTRVEGWVWKNKLLALAMVAVVWLALESVVTRVAVLVVLLCLAPVYA
SRCTHLENRDFVTGTQGTTRVTLVLELGGCVTITAEGKPSMDVWLDAIYQESPAKTREYCLHAKLSETKV
AARCPTMGPAVLTEERQIGTVCKRDQSDRGWGNHCGLFGKGSIVACVKAACEAKKKATGYVYDANKIVYT
VKVEPHTGDYVAANETHKGRKTATFTVSSEKTILTLGEYGDVSLLCRVASGVDLAQTIILELDKTAEHLP
TAWQVHRDWFNDLALPWKHDGNPHWNNAERLVEFGAPHAVKMDVYNLGDQTGVLLRALAGVPVAHIEGNK
YHLKSGHVTCEVGLEKLKMKGLTYTMCDKSKFAWKRTPTDSGHDTVVMEVTFSGSKPCRIPVRAVAHGSP
DVNVAMLITPNPTIENDGGGFIEMQLPPGDNIIYVGELSHQWFQTGSSIGRVFQTTRKGIERLTVIGEHA
WDFGSAGGFFGSIGKAVHTVLGGAFNSIFGGVGFLPKLLMGVALAWLGLNTRNPTMSMSFLLAGGLVLAM
TLGVGADVGCAVDTERMELRCGEGLVVWREVSEWYDNYAYYPETPGALASAVKEAFEEGSCGVVPQNRLE
MAMWRSSVTELNLALVEGDANLTVVVDKNDPTDYRGGVPGTLKKGKDMKVSWRSWGHSMIWSIPEAPRRF
MVGTEGQSECPLERRKTGVFTVAEFGVGLRTKVFLDFRQEPTHECDTGVMGAAVKNDMAVHTDQSLWMKS
MRNDTGTYIVELLVTDLRNCSWPASHTIDNADVVNSELFLPASLRGPRSWYNRIPGYSEQVKGPWKHTPL
RVIREECPGTTVTINAKCEKRGASVRSTTESGKVIPEWCCRACTMPPVTFRTGTDCWYAMEIRPVHAQGG
LVRSMVVADNGELLSEGGVPGIVALFVVLECIIRRRPSTGVTVVWGGVVVLALLVTGMVRIESLVRYVVA
VGIAFHLELGPETVALMLLQAVFELRVGLLSAFALRRGLTVREMVTTYFLLLVLELGLSSAGLGDLWKWS
DALAMGALIFRACTAEGKTGTGLLLIALMTQRDVVTVHHGLVCFLAAAAACSVWRLLRGHREQKGLTWII
PLARLLGGEGSVIRLLAFWELAAHRGRRSFSEPLTVVVVMLTLASGMMRHTSQEALCALAVASFFLLMLV
SGTRKMQLVAEWSGCVEWHPETVNEGGEISLRVRQDSMGNFHLTELEKEERMMAFWLLAGLVASALHWSG
ILGVMGLWTLTEIMRSSRRSDLVYSGQGGQERGDRPFEVKDGVYRIFSPGLFWGQRQVGVGYGHKGVLHT
MWHVTRGAALSIDDAVAGPYWADVKEDVVCYGGAWSLEEKWKGETVQVHAFPPGRAHEVHQCQPGELILD
TGKRLGAIPIDLAKGTSGSPILNAQGVVVGLYGNGPKTNESYVSSIAQGEAEKSRPNLPQAVVGTGWTSK
GQITVLDMHPGSGKTHRVLPELIRQCIDRRLSTLVLAPTRVVLKEMERALSGKRVRFHSPAVSDQQAGGA
IVDVMCHATYVNRRLLPQGRQNWEVAIMDEAHWTDPHSIAARGHLYTLAKENKCALVLMTATPPGKSEPF
PESNGAITSEERQIPDGEWRDGFDWITEYEGRTAWFVPSIAKGGVIARTLRQKGKSVICLNSKTFEKDYS
RVREEKPDFVVTTDISEMGANLDVSRVIDGRTNIKPEEVDGKVELTGTRRVTTASAAQRRGRVGRQDGRT
DEYIYSGQCDDDDSGLVQWKEAQILLDNITTLRGPVATFYGPEQDKMPEVAGHFRLTEEKRKHFRHLLTH
CDFTPWLAWHVAANVSSVTDRSWTWEGPEANAVDEASGDLVTFRSPNGAERTLRPVWRDARMFREGRDIK
EFVAYASGRRSFGDVLTGMSGVPELLRHRCVNALDVFYTLMHEEPGSRAMKMAERDAPEAFLTVVEMMVL
GLATLGVVWCFVVRTSISRMMLGTLVLLASLLLLWAGGVGYGNMAGVALIFYTLLTVLQPETGKQRSSDD
NKLAYFLLTLCSLAGLVAANEMGFLEKTKADLSAMLWSGHEEHRQWSEWTNVDIQPARSWGTYVLVVSLF
TPYIIHQLQTKIQQLVNSAVASGAQAMRDLGGGAPFFGVAGHVMTLGVVSLVGATPTSLIVGIGLAAFHL
AIVVSGLEAELTQRAHKVFFSAMVRNPMVDGDVINPFGEGEAKPALYERKMSLVLAIVLCLVSVVMNRTV
ASMTEAAAVGLAATGQLLRPEADTLWTMPVACGMSGVVRGSLWGFLPLGHRLWLRASGGRRGGSDGDTLG
DLWKRRLNNCTKEEFFVYRRTGILETERDKARELLRRGETNMGLAVSRGTAKLAWLEERGYRTLKGEVVD
LGCGRGGWSYYAASRPAVMSVRAYTIGGRGHEVPKMVTSLGWNLIRFRSGMDVFSMQPHRADTIMCDIGE
SNPDAAVEGERTRKVISLMEQWKIRNPAAACVFKVLAPYRPEVIEALHRFQLQWGGGLVRTPFSRNSTHE
MYYSTAVTGNIVNSVNIQSRKLLARFGDQRGPTKVPEADLGVGTRCVVLAEDKVKEQDVQERIRALRKQY
SETWHMDEEHPYRTWQYWGTSRTAPTGSAASLINGVVKLLSWPWNAREDVVRMAMTDTTAFGQQRVFKEK
VDTKAQEPQPGTRVITRAVNDWILERLAQKSKPRMCSREEFIAKVRSNAALGAWSDEQNRWASAREAVVV
PAFWALVDEVRERHLVGWCAHCVYIMMGMREKKLGEFGVAKGSRAIWYMWLGSRFLEFEALGFLNKDHWA
SRESSGGGVEGISLNYLGWHLKKLTTLNGGLFYADDTAGWDTKGTNSDPEDEEQILRYMEGEHKQLATTI
MQKAYHAKVVKVARPSRDGGCIMDVITRRDQRGSGQVVTYALNTLTNIKVQSTRMMEGEGVIEAEDAHNP
RLLRVERWLKEHGEERLGRMLVSGDDCVVRPIDDRFGKALYFLNDMAKTRKDMGEWEPSAGFSSWEEVPF
CSHHFHELVMKDGRTLVVPCRDQDELVGRARVSPGCGWSVRETACLSKAYGQMWLLSYFHRRDLRTLGFA
ISPAVPVDWVPTGRTTWSIHASGAWMTTEDMLDVWNRVWILDNPFMQNKERIMEWRDVPYLPKTQDMICS
SLVGRKERAEWAKNIWGAVEKVRKMIGPERFKDYLSCMDRHDLHWELKLESSII



Источники :
[1] www.ncbi.nlm.nih.gov
[2] zhivotnovodstvo.net.ru (W. A. Pool, A. Broun-lee, R. D. Wilson)

Назад на главную
На страницу первого семестра
© Ульянова Екатерина , 2016