| Систематическое положение | |
| Домен | Bacteria |
| Тип | Cyanobacteria |
| Порядок | Synechococcales |
| Семейство | Synechococcaceae |
| Род | Synechococcus |
| Вид | Synechococcus elongatus |
| Штамм | Synechococcus elongatus PCC 7942 |
Описание
Род Synechococcus, к которому принадлежит данный вид, объединяет цианобактерий, живущих в пресноводных и морских средах.
Являются одними из наиболее значимых фотосинтезирующих бактерий.
Бактерии производят опасный нейротоксин, который влияет на нервные клетки других организмов.
В настоящее время неизвестно вызываетмых Synechococcus elongatus заболеваний.
Synechococcus elongatus является пресноводной цианобактерией
(цианобактерий также называют сине-зелеными водорослями).
Это прокариотические организмы, способные получать энергию при помощи фотосинтеза (фотоавтотрофы).
Они являются олиготрофами, то есть способны выживать в пресноводной среде с низким уровнем питательных вещест.
К привычным средам обитания относятся теплые источники и другие пресноводные среды
предпочтительно с мезофильными условиями (умеренная температура).
История открытия
Бактерия Synechococcus elongatus была открыта в 1950 Альбертом Френкелем (Albert Frenkel)
в небольших водоемых, заполненных дождевой водой, острова Анджелика Рок (США, штат Массачусес).
Френкель и его коллеги взяли пробу воды и определили найденные сине-зеленые водоросли, как Synechococcus elongatus.
Они культивировали Synechococcus elongatus и провели тесты, чтобы подтвердить способность бактерий к фотосинтезу.
Структура генома
Геном Synechococcus elongatus представлен одной кольцевой хромосомой и двумя плазмидами.
Круговая хромосома длиной 2695903 пар нуклеотидов (содержание GC равно 55,5%).
Хромосома бактерии содержит гены, кодирующие 2612 белков и 53 РНК.
Одна из плазмид Synechococcus elongatus PCC 7942
в настоящее время секвенируется в лаборатории доктора Голдена в Техасском университет А&M (Texas A&M University)
в сотрудничество с Объединенным институтом геномов (DOE Joint Genome Institute).
Клеточная структура
Synechococcus elongatus — это одноклеточные, палочковидные бактерии (рис. 1, фото L.A. Sherman, D.M. Sherman,
Purdue University)
Могут существовать отдельно, объединяться в пары, соединяться линейно или в небольшие кластеры.
Данные цианобактерии способны плавать или скользить в воде, несмотря на отсутствие жгутиков или ресничек.
Движение не зависит от световой стимуляции.
|
|
Рис. 1 Микрофотография Synechococcus elongatus PCC 7942 [1] |
Экологическая роль
Synechococcus elongatus, являсь пресноводным видом, незначительно способствуют суммарной продукции органических веществ в мире.
Тем не менее, морские представители рода Synechococcus производт около 25% суммарного количества органических веществ
в морской среде посредством фотосинтеза
[2].
В таблице №1 Вы можете найти описание белка с идентификатором YP_400610.1 из генома бактерии, его геномное окружение.
В таблице №2 и на рисунке 2 представлена информация о протеоме бактерии.
| ○ Таблица №2 ○ Гистограмма числа белков различной длины Synechococcus elongatus PCC 7942 |
|
| Range | Count |
| 1..100 | 263 |
| 101..200 | 682 |
| 201..300 | 589 |
| 301..400 | 440 |
| 401..500 | 294 |
| 501..600 | 138 |
| 601..700 | 74 |
| 701..800 | 46 |
| 801..900 | 31 |
| 901..1000 | 21 |
| >1000 | 33 |
|
| Рис. 2 Гистограмма числа белков различной длины Synechococcus elongatus PCC 7942 |
Исходя из приведенных данных, можно заключить, что в геноме Synechococcus elongatus больше всего белков длины в диапазоне от 101 до 200 нуклеотидов. Белки длиной 600 аминокислотных остатков и длиннее для бактерии не характерны (редко встречаются).