Uniprot и Refseq Protein
Uniprot и Refseq Protein
|
Таблица №1 Общая информация о белке |
|
| Uniprot ID | ALDEC_SYNE7 |
| Uniprot AC | Q54764 |
| Refseq ID | WP_011378104.1, NC_007604.1 |
| PDB ID | 4QUW, 4RC5, 4RC6, 4RC7, 4RC8 |
| Длина | 231 AA |
| Молекулярная масса | 26369 MW |
| Рекомендуемое Unirpot название | Aldehyde decarbonylase |
Белок состоит из одной цепи, однако во всех файлах PDB, кроме 4RC8 и 4QUW, описаны две цепи. Для всего фермента известна структура, она представлена в файле 4QUW. В активном центре фермента присутстуют два иона Fe2+.
|
Таблица №2 Описание кластеров Uniref |
||
| Идентификация кластера | Количество белков | Что-то еще |
| UniRef50_Q55688 | 267 | Некоторые бактерии, имеющие этот белок, относятся к разным классам. Большинство - представители разных порядков |
| UniRef90_Q54764 | 4 | Организмы относятся к разным видам внутри одного рода |
| UniRef100_Q54764 | 4 | Организмы и белки те же самые, что и в предыдущем кластере |
|
Таблица №3 Общая информация о белке |
||
| Текст запроса | Количество белков | Reviewed |
| Aldehyde decarbonylase (полное название) | 210 | 4 |
| AD (краткое название) | 3140 | 184 |
| taxonomy:chroococcales name:ad | 82 | 2 |
| name:ad taxonomy:cyanobacteria | 184 | 4 |
| name:cytochrome taxonomy:metazoa | 836911 | 3271 |
| name:trypsin | 11309 | 301 |
| name:trypsin name:inhibitor | 2558 | 203 |
Chroococcales - это порядок моей цианобактерии, что не соответствует заданию, однако в файле UniProt нет информации по семейству. По указанному в Wikipedia - Synechococcaceae - семейству не нашлось файлов.