Uniprot и Refseq Protein


Таблица №1
Общая информация о белке
Uniprot IDALDEC_SYNE7
Uniprot ACQ54764
Refseq IDWP_011378104.1, NC_007604.1
PDB ID4QUW, 4RC5, 4RC6, 4RC7, 4RC8
Длина231 AA
Молекулярная масса26369 MW
Рекомендуемое Unirpot названиеAldehyde decarbonylase

Белок состоит из одной цепи, однако во всех файлах PDB, кроме 4RC8 и 4QUW, описаны две цепи. Для всего фермента известна структура, она представлена в файле 4QUW. В активном центре фермента присутстуют два иона Fe2+.

Таблица №2
Описание кластеров Uniref
Идентификация кластераКоличество белковЧто-то еще
UniRef50_Q55688267Некоторые бактерии, имеющие этот белок, относятся к разным классам. Большинство - представители разных порядков
UniRef90_Q547644Организмы относятся к разным видам внутри одного рода
UniRef100_Q547644Организмы и белки те же самые, что и в предыдущем кластере

Таблица №3
Общая информация о белке
Текст запросаКоличество белковReviewed
Aldehyde decarbonylase (полное название)2104
AD (краткое название)3140184
taxonomy:chroococcales name:ad822
name:ad taxonomy:cyanobacteria1844
name:cytochrome taxonomy:metazoa8369113271
name:trypsin11309301
name:trypsin name:inhibitor2558203

Chroococcales - это порядок моей цианобактерии, что не соответствует заданию, однако в файле UniProt нет информации по семейству. По указанному в Wikipedia - Synechococcaceae - семейству не нашлось файлов.