Uniprot и Refseq Protein
Uniprot и Refseq Protein
|
Таблица №1 Общая информация о протеомах |
||
| Synechococcus elongatus (strain PCC 7942) | Escherichia coli (strain K12) | |
| Идентификатор протеома | UP000002717 | UP000000625 |
| Число последовательностей | 3179 | 4306 |
| Число остатков | 823057 | 1380832 |
|
Таблица №2 Информация об остатках в протеомах |
|||
| Остаток | Процент в протеоме S.elongatus | Процент в протеоме E.coli | Разность, % |
| U | 0,0000 | 0,0002 | 0,0002 |
| C | 1,0829 | 1,1576 | 0,0747 |
| M | 1,5626 | 2,8193 | 1,2567 |
| H | 1,7244 | 2,2664 | 0,5420 |
| W | 1,7505 | 1,5312 | -0,2193 |
| Y | 2,4545 | 2,8453 | 0,3909 |
| K | 2,5850 | 4,4061 | 1,8211 |
| N | 2,7492 | 3,9454 | 1,1962 |
| F | 3,4663 | 3,8905 | 0,4241 |
| D | 5,1358 | 5,1510 | 0,0152 |
| T | 5,2100 | 5,3991 | 0,1890 |
| I | 5,4398 | 6,0103 | 0,5705 |
| P | 5,4948 | 4,4254 | -1,0695 |
| E | 5,7012 | 5,7628 | 0,0616 |
| S | 6,0192 | 5,8023 | -0,2169 |
| Q | 6,1449 | 4,4401 | -1,7047 |
| V | 6,6287 | 7,0734 | 0,4447 |
| R | 6,7935 | 5,5110 | -1,2825 |
| G | 7,1953 | 7,3746 | 0,1793 |
| A | 10,5474 | 9,5154 | -1,0320 |
| L | 12,3141 | 10,6726 | -1,6415 |
Три самых редких остатка различны для протеомов бактерий. В протеоме E.coli наименее распростанен U (селеноцистеин), у S.elongatus
он полностью отсутствует. В протеоме S.elongatus в число редких аминокислотных остатков также входят цистеин (С) и метионин (М), а в
протеоме кишечной палочки - цистеин и триптофан (W).
Больше всего глицина (G), аланина (A) и лейцина (L) в белках обеих бактерий.
Наиболее существенное отличие наблюдается в содержании лейцина (L): в протеоме цианобактерии на 1,8% меньше остатков этой аминокислоты, чем
в протеоме E.coli.