Изображение выравниваний


Последовательности
1. R5XST5_9FIRM
2. D5UFQ6_CELFN
3. R6L8V7_9BACE
4. D4INR0_9BACT
5. F9D5I9_PREDD
6. GCSH_SHEPA
скачаны из UniProt, добавлены в один файл и открыты программой JalView. Далее строится множественное выравнивание программой Muscle с параметрами по умолчанию. Негомологичной оказалась последовательность R5XST5_9FIRM. Чтобы найти негомологичную последовательность было сделано множественное выравнивание, раскрашено по схеме BLOSUM62. Аналогично, удаляя по одной последовательности. В выравнивании без лишней последовательности значительно больше консервативных колонок.

Рис. 1 Выравнивание

Проект JalView
fasta
msf