Проект доступен по ссылке.

Протокол выполнения задания

Для поиска блоков в выравнивании использовался N-концевой домен белков ARMET.
В процессе нахождения блока используются составленные для конкретного множественного выравнивания паттерны, включающие в себя наиболее часто встречающиеся в каком-либо участке выравнивания аминокислотные остатки, а также те, которые могут их заменять. Результаты представлены в таблице 1.

Таблица 1. Описание паттернов для поиска блоков
Блок	Координаты	Паттерн
Вертикальный плюс-блок	1-16 столбцы	[DENQ]C[EPEQ]VC..[VTFHFA][VIL].[KRTSND][FLV]..[TSYKRQG][LIV]
Частичный плюс-блок	19-27 столбцы	[KR]GV[DN]FS[QVL][ED][IT]
Минус-блок	17-23 столбцы	Нет