Качество прочтения (Phred quality score, среднее по последовательности)
23
28
Примеры проблемных нуклеотидов
Рис. 1. На прямой хроматограмме (нуклеотиды 476-478) сигнал от А зашумлен сигналом от Т. По обратной последовательности можно восстановить здесь три подряд идущих А нуклеотида
Рис. 2. 450-й нуклеотид восстанавливается по обратной хроматограмме
Рис. 3. Аналогично рис. 2
Рис. 4. Аналогично рис. 2
Рис. 5. 434-й и 436-й нуклеотиды обратной хроматограммы восстаналиваются по соответствующим сигналам прямой хроматограммы
Рис. 6. Пятно краски
Пример нечитаемого фрагмента
Для просмотра был выбран файл L46_COI_F_A07_WSBS-Seq-07-10-16.ab1 из директории P:\y19\term3\block2\ab1_files\bad
Рис. 7. Пики повторяются на протяжении практически всей хроматограммы. Качество прочтения - 18%. Возможно, было проскальзывание полимеразы
