Описание семейства доменов, выбранного для анализа.
AC семейства: PF07646
ID: Kelch_2
Название: Kelch motif
Число последовательностей в seed: 41
Число последовательностей в full: 3885
Число доменных архитектур: 563
Описание функции домена: Присутствует в актиновых сщивающих белках, может выполнять функцию цитоскелета, поскольку локализован в богатых актином кольцевых каналах, которые соединяют 15 клеток-кормилиц (nurse cells) с развивающимся ооцитом у дрозофилы (Drosophila).
Таксономическая распространённость домена: Появляется 6 раз в регуляторном белке яичной камеры дрозофилы (Drosophila), встречается в мышином белке MIPP, у некоторых поксвирусов (Poxviruses), а также в галактозооксидазе плесени шампиньонов (Dactylium dendroides).
Описание выравнивания seed.
Максимальные достоверные блоки, включающие все последовательности: Отсутствуют.
Максимальный достоверный блок, включающий не все последовательности: на 64 позиции выравнивания при идентичности 80% находится блок триптофанов.
Участок выравнивания, в котором нет никаких достоверных подблоков: Присутствуют еденичные случаи на позиция 58 и 65, считаю это не достаточным для подтверждения маловероятности отражения хода эволюции в данном выравнивании.
Участок выравнивания, не содержащий все последовательности: с 33 по 39 позиции выравнивания - большая часть пространства - гэпы. Только у Q9UF94_HUMAN, Q9VTZ7_DROME и Y1773_VIBCH на этом участке есть участки последовательностей, которые не являются достоверными.
Вывод: Данное выравнивание отражает гомологию последовательностей в редких местах, более того, триптофан является самой консервативной аминокислотой, но даже он не образовал домен со 100% идентичностью. Я считаю что это выравнивание не отражает ход эволюции.