Общие сведения о белке Uronate dehydrogenase

Белок Uronate dehydrogenase экспрессируется геном udh. Выделен из бактерии Agrobacterium fabrum (штамм C58 / ATCC 33970) (Agrobacterium tumefaciens (штамм C58)), грам-отрицательной альфа-протеобактерии, которая вызывает образование корончатых галлов у растений[1]. Катализирует окисление D-галактуроновой и D-глюкуроновой кислот до галактарата и D-глюкарата соответственно[2]. Составляет часть пути окислительной деградации D-галактуроната, который позволяет A.tumefaciens использовать это соединение в качестве единственного источника углерода[3]. Не активен в отношении D-галактозы, D-глюкозы, D-галактоната и D-глюконата[4].

Катализируемая реакция[4]:

β-D-galacturonate + NAD+ = D-galactaro-1,5-lactone + H+ + NADH

Литература:

  1. Chilton MD, Drummond MH, Merio DJ, Sciaky D, Montoya AL, Gordon MP, Nester EW, Stable incorporation of plasmid DNA into higher plant cells: the molecular basis of crown gall tumorigenesis, Cell, 1977.
  2. Parkkinen T., Boer H., Janis J., Andberg M., Penttila M., Koivula A., Rouvinen J., Crystal structure of uronate dehydrogenase from Agrobacterium tumefaciens, J. Biol. Chem., 2011.
  3. Boer H., Maaheimo H., Koivula A., Penttila M., Richard P., Identification in Agrobacterium tumefaciens of the D-galacturonic acid dehydrogenase gene, Appl. Microbiol. Biotechnol., 2010.
  4. Yoon S.H., Moon T.S., Iranpour P., Lanza A.M., Prather K.J., Cloning and characterization of uronate dehydrogenases from two pseudomonads and Agrobacterium tumefaciens strain C58, J. Bacteriol., 2009.