Pyridoxine kinase
Для работы нашей группе была предложена Bacillus subtilis – сенная палочка. Bacillus subtilis штамма 168 представлен кольцевой двуцепочечной молекулой ДНК размером 4214814 п.н. и содержит 5279 генов, из которых 5163 кодируют белки. Мне был предложен белок Pyridoxine kinase (см. рисунок).
Рисунок - Изображение структуры белка Pyridoxine kinase
| Название белка | Pyridoxine kinase (Bacillus subtilis (strain 168)) |
| Полное английское | Pyridoxal kinase |
| Полное русское | Пиридоксин-киназа |
| Альтернативные названия |
PN/PL/PM kinase Pyridoxal kinase Pyridoxamine kinase Vitamin B6 kinase |
| Организм, в котором найден белок | Bacillus subtilis (strain 168) |
| Ген, кодирующий белок | pdxK |
| Локус гена | BSU38020 |
| SwissProt ID | PDXK_BACSU |
| Uniprot AC | P39610 |
| PDB (Protein Data Bank) ID | 2I5B |
| Число аминокислотных остатков | 271 |
| Функции |
Фосфорилирует провитамины B6. Также может фосфорилировать гидроксиметилпирамидин C5H6N2O. ATP + pyridoxal = ADP + pyridoxal 5'-phosphate. АТФ + пиридоксаль = АДФ + пиридоксаль 5'-фосфат. |
Информация о белке Pyridoxine kinase была получена в базе данных Swiss-Prot.
Полезная информация:
Информация о пространственной структуре белка
Последовательность белка в fasta формате:
>|P39610|PDXK_BACSU Pyridoxine kinase OS=Bacillus subtilis (strain 168) GN=pdxK PE=1 SV=1
MSMHKALTIAGSDSSGGAGIQADLKTFQEKNVYGMTALTVIVAMDPNNSWNHQVFPIDTDTIRAQLATITDGIGVDAMKTGMLPTVDIIE
LAAKTIKEKQLKNVVIDPVMVCKGANEVLYPEHAQALREQLAPLATVITPNLFEASQLSGMDELKTVDDMIEAAKKIHALGAQYVVITGG
GKLKHEKAVDVLYDGETAEVLESEMIDTPYTHGAGCTFSAAVTAELAKGAEVKEAIYAAKEFITAAIKESFPLNQYVGPTKHSALRLNQQS
Источники информации:
1. http://www.uniprot.org/uniprot/P39610#section_name (база данных Swiss-Prot).
2. http://www.pdb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=2I5B.
Страница будет пополняться результатами блока 2.