SRS

SRS


1. Особенности белка PDXK_BACSU

Результат запроса Описание свойства 
ID   PDXK_BACSU_3;  parent: PDXK_BACSU
FT   METAL       144    144       Magnesium (By similarity).
SQ   Sequence     1 AA;
     E
 Белок связывает один ион магния. 
ID   PDXK_BACSU_2;  parent: PDXK_BACSU
FT   NP_BIND     178    182       ATP.
SQ   Sequence     5 AA;
     TGGGK
 Белок связывается с лигандом – ATP (аденозинтрифосфат). 
ID   PDXK_BACSU_13;  parent: PDXK_BACSU
FT   TURN         46     50
SQ   Sequence     5 AA;
     PNNSW

ID   PDXK_BACSU_26;  parent: PDXK_BACSU
FT   TURN        169    171
SQ   Sequence     3 AA;
     ALG
 В последовательности есть два участка, за счет которых происходит поворот цепи.

2. Описание всех записей банка трехмерных структур PDB, относящихся к PDXK_BACSU

В банке трехмерных структур была найдена 1 запись, относящаяся к белку PDXK_BACSU. Результат запроса можно посмотреть в файле.

3. Таблица встречаемости в SwissProt белков из Firmicutes , имеющих функцию, сходную с функцией белка PDXK_BACSU из Bacillus subtilis

Формулировка действия белка Строка запроса Количество найденных документов
Pyridoxine kinase (([swissprot-Taxonomy:Firmicutes*] & [swissprot-Description:kinase*]) & [swissprot-Description:Pyridoxine*]) 4
PN/PL/PM kinase ([swissprot-Taxonomy:Firmicutes*] & (([swissprot-Description:PN/PL/PM*] & [swissprot-Description:kinase*]) | [swissprot-Description:PN/PL/PM kinase*])) 4
Pyridoxine kinase ([swissprot-Taxonomy:Firmicutes] & (([swissprot-Description:Pyridoxine] & [swissprot-Description:kinase]) ! [swissprot-Description:fragment])) 4

4. Полноразмерные последовательности найденных белков в fasta формате

Последовательности найденных белков представлены в файле.

5. Список последовательностей из задания 4, в котором указана дополнительная информация

Список последовательностей можно посмотреть в таблице.

6. Поле Taxonomy банка SwissProt