Занятие 6.

Метаболические пути, в которых участвует фермент Telomerase-binding protein EST1A

Код белка в KEGG - hsa:23293. C ним ассоциирован 1 метаболический путь. Этот путь предназначен для того, чтобы обнаруживать и при необходимости разлагать слишком большое количество мРНК.

Идентификатор KEGG	Английское название	Русское название
hsa03015	mRNA surveillance pathway	Путь "слежения" за мРНК

Посмотреть схему метаболической пути можно, перейдя по ссылке

Поиск структурных формул заданных соединений в KEGG

В задании требовалось провести поиск по базе лигандов двух веществ - 0-фосфо-L-серин и L-аллотреонина. Результаты поиска отражены в следующей таблице:

Название на русском	Название на английском	Идентификатор	Структурная формула
0-фосфо-L-серин	O-Phospho-L-serine	C01005
L-аллотреонин	L-Allothreonine	C05519

Поиск метаболического пути от одного заданного вещества к другому

С помощью инструмента работы с картами метаболических путей (KEGG -> KEGG PATHWAY -> Search&Color Pathway) можно найти карты, в которых присутствуют нужные соединения, а затем найти путь, соединяющий два вещества. Для этого в поле ввода запроса следует записать идентификаторы соединений и цвет, в который хотим их покрасить:

C01005 red
C05519 green

Была найдена одна карта, включающая оба соединения.

Карта: метаболизм глицина ,серина и треонина

Путь: фосфосерин>L-аллотреонин

Найденный путь отметили на карте: записали идентификаторы промежуточчных соединений и в Search&Color Pathway покрасили их в желтый цвет:

C01005 red
C05519 green
C00065 yellow
C00037 yellow

Посмотреть отмеченный путь можно, перейдя по ссылке