Седьмой семестр

Задание 4. Изучение файла структурных факторов


PDB ID выбранной структуры - 2i5b. Файл структурных факторов 2i5b-sf.cif можно скачать с сайта PDB в формате mmCIF. В файле содержится информация о всех структурных факторах, измеренных в ходе эксперимента. Ниже представлен фрагмент файла:

 loop_
_refln.wavelength_id
_refln.crystal_id
_refln.scale_group_code
_refln.index_h
_refln.index_k
_refln.index_l
_refln.status
_refln.F_meas_au 
_refln.F_meas_sigma_au 
 1 1 1       0    0   20 x         ?      ?
 1 1 1       0    0   24 x         ?      ?
 1 1 1       0    0   28 x         ?      ?
 1 1 1       0    0   32 x         ?      ?
 1 1 1       0    0   36 x         ?      ? 
............................................
 

Данные об измеренных структурных факторах начинаются со строки "loop_", в столбец идут названия колонок, а далее - измеренные величины (одна строчка = один измеренный структурный фактор). Таблица excel с таблицей структурных факторов - в файле 2I5Bsf.xlsx

В файле 33495 структурных факторов (поле _reflns.number_all). Для оптимизации использовалось 31617 структурных факторов (число строчек со значением "о" в колонке _refln.status)

В файле можно найти примеры неизмеренных структурных факторов, которые соотвествуют явно пропущенным тройкам чисел (h,k, l). Явно пропущенные - это такие, что (1) их нет в файле; (2) хотя бы одна тройка (h',k', l') с h'>=h, k'>=k, l'>=l Присутствует в файле. Ниже представлен фрагмент файла, в котором пропущены тройки:

 1 1 1       0    0   21 x         ?      ?
 1 1 1       0    0   22 x         ?      ?
 1 1 1       0    0   23 x         ?      ?
 1 1 1       0    0   25 x         ?      ? 
 1 1 1       0    0   26 x         ?      ?
 1 1 1       0    0   27 x         ?      ?
 1 1 1       0    0   29 x         ?      ?
 1 1 1       0    0   30 x         ?      ?
 1 1 1       0    0   31 x         ?      ?
 1 1 1       0    0   33 x         ?      ?