Задание 4. Изучение файла структурных факторов
PDB ID выбранной структуры - 2i5b. Файл структурных факторов 2i5b-sf.cif можно скачать с сайта PDB в формате mmCIF. В файле содержится информация о всех структурных факторах, измеренных в ходе эксперимента. Ниже представлен фрагмент файла:
loop_ _refln.wavelength_id _refln.crystal_id _refln.scale_group_code _refln.index_h _refln.index_k _refln.index_l _refln.status _refln.F_meas_au _refln.F_meas_sigma_au 1 1 1 0 0 20 x ? ? 1 1 1 0 0 24 x ? ? 1 1 1 0 0 28 x ? ? 1 1 1 0 0 32 x ? ? 1 1 1 0 0 36 x ? ? ............................................
Данные об измеренных структурных факторах начинаются со строки "loop_", в столбец идут названия колонок, а далее - измеренные величины (одна строчка = один измеренный структурный фактор). Таблица excel с таблицей структурных факторов - в файле 2I5Bsf.xlsx
В файле 33495 структурных факторов (поле _reflns.number_all). Для оптимизации использовалось 31617 структурных факторов (число строчек со значением "о" в колонке _refln.status)
В файле можно найти примеры неизмеренных структурных факторов, которые соотвествуют явно пропущенным тройкам чисел (h,k, l). Явно пропущенные - это такие, что (1) их нет в файле; (2) хотя бы одна тройка (h',k', l') с h'>=h, k'>=k, l'>=l Присутствует в файле. Ниже представлен фрагмент файла, в котором пропущены тройки:
- 0 0 24
- 0 0 28
- 0 0 32
1 1 1 0 0 21 x ? ? 1 1 1 0 0 22 x ? ? 1 1 1 0 0 23 x ? ? 1 1 1 0 0 25 x ? ? 1 1 1 0 0 26 x ? ? 1 1 1 0 0 27 x ? ? 1 1 1 0 0 29 x ? ? 1 1 1 0 0 30 x ? ? 1 1 1 0 0 31 x ? ? 1 1 1 0 0 33 x ? ?