Скрипт

Пример работы скрипта

Скачать скрипт на языке python можно здесь.

Данный скрипт читает файл в формате .fasta[1] и считает длину последовательности аминокислот, записанной в нем. Затем он создает новый файл с заданным пользователем именем и перезаписывает туда данные из исходного файла, причем длина строки в новом файле задается пользователем.

Поскольку скрипт обрабатывает единственный файл, нет нужды импортировать аргументы из командной строки. Поэтому названия файлов и длина строки в новом файле вводятся вручную командой raw_input.

На рис.1 представлен вид отработавшего скрипта в командной строке.

Рис.1. Снимок экрана после завершения работы скрипта

Ссылки

[1] Подробнее о формате .fasta здесь: Wikipedia