Прочие водородные связи во вторичной структуре ABC-транспортерного периплазматического связывающего аминокислоты белка

Во вторичной структуре исследуемого белка водородные связи присутствуют не только в α-спиралях, β-листах, в виде солевых мостиков, но и просто между частично положительно и частично отрицательно заряженными атомами разных аминокислотных остатков. Например, на рис.1 представлена подобная связь между атомом азота в радикале гистидина и атомом кислорода в радикале аспарагина.

Рис.1. Водородная связь между аспарагином и гистидином. Красным цветом обозначены атомы кислорода, синим - атомы азота. Водородные связи покрашены в зеленый цвет. Изображение получено при помощи графического интерпритатора Jmol.

При образовании этой связи донором водорода будет радикал гистидина, акцептором - кислород радикала аспарагина.

Также возможно существоввание так называемых водяных мостиков. Это водородные связи между молекулой воды и 2 различными аминокислотными остатками белка.К сожалению, в исследуемом белке подобных связей найти не удалось.