Выравнивание, построенное ClustalW
(Цветом выделены участки, присутствующие в эталонном выравнивании)

*

2

0

*

4

0

*

6

0

*

D

E

O

D

_

E

C

O

L

I

:

-

A

T

P

H

I

N

A

E

M

G

D

F

A

D

V

V

L

M

P

G

D

P

L

R

A

K

Y

I

A

E

T

F

L

E

D

A

R

E

V

N

N

V

R

G

M

L

G

F

T

G

T

Y

K

G

R

K

I

S

V

M

G

H

G

M

G

I

P

S

C

S

I

Y

T

K

E

:

7

5

D

E

O

D

_

L

A

C

L

C

:

M

P

T

P

H

I

E

A

Q

K

G

E

I

A

D

K

I

L

L

P

G

D

P

L

R

A

K

F

I

A

E

N

F

L

E

D

A

V

Q

F

N

Q

V

R

G

M

L

G

F

T

G

T

Y

K

G

H

R

V

S

V

M

G

T

G

M

G

I

P

S

I

S

I

Y

A

N

E

:

7

6

D

E

O

D

_

B

A

C

S

U

:

-

M

S

V

H

I

G

A

E

K

G

Q

I

A

D

T

V

L

L

P

G

D

P

L

R

A

K

F

I

A

E

T

Y

L

E

N

V

E

C

Y

N

E

V

R

G

M

Y

G

F

T

G

T

Y

K

G

K

K

I

S

V

Q

G

T

G

M

G

V

P

S

I

S

I

Y

V

N

E

:

7

5

M

T

N

N

_

H

A

E

I

N

:

M

K

I

G

I

V

G

A

M

A

Q

E

V

E

I

L

K

N

L

M

A

D

R

T

E

T

R

V

A

S

A

V

I

F

E

G

K

I

N

G

K

D

V

A

L

L

Q

S

G

I

G

K

V

A

A

A

I

G

T

T

A

L

L

Q

L

A

K

P

D

C

V

I

N

T

G

S

:

7

6

M

T

N

N

_

T

R

E

P

A

:

M

T

V

G

V

F

A

A

L

G

E

E

V

A

R

V

R

E

C

L

G

G

-

V

G

T

E

R

A

G

L

T

F

Y

V

V

S

V

G

A

L

Q

V

V

Y

V

C

G

G

V

G

K

V

N

A

A

L

C

T

Q

L

L

I

S

E

F

G

A

R

V

L

I

N

T

G

I

:

7

5

A

V

6

G

3

I

8

0

*

1

0

0

*

1

2

0

*

1

4

0

*

D

E

O

D

_

E

C

O

L

I

:

L

I

T

D

F

G

V

K

K

I

I

R

V

G

S

C

G

A

V

L

P

H

V

K

L

R

D

V

V

I

G

M

G

A

C

T

D

S

K

V

N

R

I

R

F

K

D

H

D

F

A

A

I

A

D

F

D

M

V

R

N

A

V

D

A

A

K

A

L

G

-

-

-

-

-

-

:

1

4

5

D

E

O

D

_

L

A

C

L

C

:

L

I

T

E

Y

G

V

K

R

L

I

R

V

G

T

A

G

S

V

N

E

D

V

H

I

R

D

L

V

I

G

Q

A

A

A

T

T

S

A

I

V

R

H

D

F

P

D

F

D

F

P

Q

I

A

D

F

D

L

L

D

K

A

Y

H

I

A

K

D

L

G

-

-

-

-

-

-

:

1

4

6

D

E

O

D

_

B

A

C

S

U

:

L

I

Q

S

Y

D

V

Q

N

L

I

R

V

G

S

C

G

A

I

R

K

D

V

K

V

R

D

V

I

L

A

M

T

S

S

T

D

S

Q

M

N

R

V

A

F

G

S

V

D

F

A

P

C

A

D

F

E

L

L

K

N

A

Y

D

A

A

K

D

K

G

-

-

-

-

-

-

:

1

4

5

M

T

N

N

_

H

A

E

I

N

:

A

G

G

V

A

K

G

L

K

V

G

D

I

V

I

S

D

E

T

R

Y

H

D

A

D

V

T

A

F

G

Y

E

K

G

Q

L

P

-

-

-

-

-

-

-

-

A

N

P

A

A

F

L

S

D

K

K

L

A

D

L

A

Q

E

I

A

E

K

Q

G

-

-

-

-

-

-

-

:

1

3

7

M

T

N

N

_

T

R

E

P

A

:

A

G

A

L

D

E

R

L

C

V

F

D

V

L

V

S

V

D

A

V

Q

H

D

V

D

V

T

A

F

G

Y

Q

K

G

R

I

P

R

M

D

S

V

E

W

T

A

N

T

A

L

R

Y

L

V

R

E

A

F

D

L

C

T

R

D

P

E

W

T

E

G

A

C

A

L

S

G

:

1

5

1

6

6

1

6

0

*

1

8

0

*

2

0

0

*

2

2

0

D

E

O

D

_

E

C

O

L

I

:

-

-

-

-

-

-

-

-

I

D

A

R

V

G

N

L

F

S

A

D

L

F

Y

S

P

D

G

E

M

F

D

V

M

E

K

Y

G

-

I

L

G

V

E

M

E

A

A

G

I

Y

G

V

A

A

E

F

G

A

K

A

L

T

I

C

T

V

S

D

H

I

R

T

H

E

Q

T

:

2

1

2

D

E

O

D

_

L

A

C

L

C

:

-

-

-

-

-

-

-

-

I

T

T

H

V

G

N

I

L

S

S

D

L

F

Y

G

G

P

D

-

-

A

V

K

V

G

K

L

G

-

V

K

A

V

E

M

E

A

A

G

L

Y

Y

L

G

A

K

Y

K

V

Q

T

L

G

I

M

T

I

S

D

H

I

L

T

G

E

S

T

:

2

1

1

D

E

O

D

_

B

A

C

S

U

:

-

-

-

-

-

-

-

-

V

P

V

T

V

G

S

V

F

T

A

D

Q

F

Y

N

D

D

S

-

Q

I

E

K

L

A

K

Y

G

-

V

L

G

V

E

M

E

T

T

A

L

Y

T

L

A

A

K

H

G

R

K

A

L

S

I

L

T

V

S

D

H

V

L

T

G

E

E

T

:

2

1

1

M

T

N

N

_

H

A

E

I

N

:

-

-

-

-

-

-

-

-

Q

S

V

K

R

G

L

I

C

S

G

D

S

F

I

N

S

E

D

K

I

A

Q

I

K

A

D

F

P

N

V

T

G

V

E

M

E

A

T

A

I

A

Q

V

C

Y

A

F

N

V

P

F

V

V

V

R

A

I

S

D

G

G

-

-

D

G

K

A

:

2

0

3

M

T

N

N

_

T

R

E

P

A

:

S

G

D

P

P

S

R

V

S

R

L

V

E

G

R

V

A

S

G

D

L

F

V

S

D

A

Q

T

R

A

R

I

I

R

E

F

G

-

A

H

G

V

E

M

E

G

A

A

F

A

H

V

A

S

V

N

G

V

P

F

V

I

I

R

C

I

S

D

G

A

G

A

E

Q

D

V

:

2

2

6

G

6

3

D

F

V

E

M

E

6

6

6

6

S

D

*

2

4

0

*

2

6

0

*

D

E

O

D

_

E

C

O

L

I

:

T

A

A

E

R

Q

T

T

F

N

D

M

I

K

I

A

L

E

S

V

L

L

G

D

K

E

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

:

2

3

8

D

E

O

D

_

L

A

C

L

C

:

T

S

E

E

R

Q

L

T

F

T

D

M

M

K

V

G

L

E

T

L

I

A

E

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

:

2

3

4

D

E

O

D

_

B

A

C

S

U

:

T

A

E

E

R

Q

T

T

F

H

D

M

I

E

V

A

L

H

S

V

S

Q

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

:

2

3

3

M

T

N

N

_

H

A

E

I

N

:

S

M

S

F

E

E

F

L

P

L

A

A

K

Q

S

S

A

L

V

L

G

M

I

D

R

L

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

:

2

2

9

M

T

N

N

_

T

R

E

P

A

:

S

M

S

Y

K

E

F

S

T

R

A

A

R

R

S

A

L

L

T

L

R

V

L

E

R

L

S

A

L

R

T

S

V

V

A

S

L

F

P

M

V

V

V

:

2

6

9

3

2

6

Матрица попарной идентичности

Результаты

• число колонок во фрагменте из SMART - 72
• число колонок, совпавших с колонками в файле clustalw.msf - 0