######################################## # Program: needle # Rundate: Thu Nov 03 00:32:28 2005 # Align_format: srspair # Report_file: gene1-gene2.needle ######################################## #======================================= # # Aligned_sequences: 2 # 1: ECBTUB # 2: ECUW89 # Matrix: EDNAFULL # Gap_penalty: 10.0 # Extend_penalty: 0.5 # # Length: 1846 # Identity: 1842/1846 (99.8%) # Similarity: 1842/1846 (99.8%) # Gaps: 2/1846 ( 0.1%) # Score: 9182.0 # # #======================================= ECBTUB 1 atgattaaaaaagcttccctgctgacggcgtgttccgtcacggcattttc 50 |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 1 atgattaaaaaagcttcgctgctgacggcgtgttccgtcacggcattttc 50 ECBTUB 51 cgcttgggcacaggataccagcccggatactctcgtcgttactgctaacc 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 51 cgcttgggcacaggataccagcccggatactctcgtcgttactgctaacc 100 ECBTUB 101 gttttgaacagccgcgcagcactgtgcttgcaccaaccaccgttgtgacc 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 101 gttttgaacagccgcgcagcactgtgcttgcaccaaccaccgttgtgacc 150 ECBTUB 151 cgtcaggatatcgaccgctggcagtcgacctcggtcaatgatgtgctgcg 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 151 cgtcaggatatcgaccgctggcagtcgacctcggtcaatgatgtgctgcg 200 ECBTUB 201 ccgtcttccgggcgtcgatatcacccaaaacggcggttcaggtcagctct 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 201 ccgtcttccgggcgtcgatatcacccaaaacggcggttcaggtcagctct 250 ECBTUB 251 catctatttttattcgcggtacaaatgccagtcatgtgttggtgttaatt 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 251 catctatttttattcgcggtacaaatgccagtcatgtgttggtgttaatt 300 ECBTUB 301 gatggcgtacgcctgaatctggcgggggtgagtggttctgccgaccttag 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 301 gatggcgtacgcctgaatctggcgggggtgagtggttctgccgaccttag 350 ECBTUB 351 ccagttccctattgcgcttgtccagcgtgttgaatatatccgtgggccgc 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 351 ccagttccctattgcgcttgtccagcgtgttgaatatatccgtgggccgc 400 ECBTUB 401 gctccgctgtttatggttccgatgcaataggcggggtggtgaatatcatc 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 401 gctccgctgtttatggttccgatgcaataggcggggtggtgaatatcatc 450 ECBTUB 451 acgacgcgcgatgaacccggaacggaaatttcaggagggtggggaagcaa 500 ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||| ECUW89 451 acgacgcgcgatgaacccggaacggaaatttcagcagggtggggaagcaa 500 ECBTUB 501 tagttatcagaactatgatgtctctacgcagcaacaactgggggataaga 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 501 tagttatcagaactatgatgtctctacgcagcaacaactgggggataaga 550 ECBTUB 551 cacgggtaacgctgttgggcgattatgcccatactcatggttatgatgtt 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 551 cacgggtaacgctgttgggcgattatgcccatactcatggttatgatgtt 600 ECBTUB 601 gttgcctatggtaataccggaacgcaagcgcagacagataacgatggttt 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 601 gttgcctatggtaataccggaacgcaagcgcagacagataacgatggttt 650 ECBTUB 651 tttaagtaaaacgctttatggcgcgctggagcataactttactgatgcct 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 651 tttaagtaaaacgctttatggcgcgctggagcataactttactgatgcct 700 ECBTUB 701 ggagcggctttgtgcgcggctatggctatgataaccgtaccaattatgac 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 701 ggagcggctttgtgcgcggctatggctatgataaccgtaccaattatgac 750 ECBTUB 751 gcgtattattctcccggttcaccgttgctcgatacccgtaaactctatag 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 751 gcgtattattctcccggttcaccgttgctcgatacccgtaaactctatag 800 ECBTUB 801 ccaaagttgggacgccgggctgcgctataacggcgaactgattaaatcac 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 801 ccaaagttgggacgccgggctgcgctataacggcgaactgattaaatcac 850 ECBTUB 851 aactcattaccagctatagccatagcaaagattacaactacgatccccat 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 851 aactcattaccagctatagccatagcaaagattacaactacgatccccat 900 ECBTUB 901 tatggtcgttatgattcgtcggcgacgctcgatgagatgaagcaatacac 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 901 tatggtcgttatgattcgtcggcgacgctcgatgagatgaagcaatacac 950 ECBTUB 951 cgtccagtgggcaaacaatgtcatcgttggtcacggtagtattggtgcgg 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 951 cgtccagtgggcaaacaatgtcatcgttggtcacggtagtattggtgcgg 1000 ECBTUB 1001 gtgtcgactggcagaaacagactacgacgccgggtacaggttatgttgag 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 1001 gtgtcgactggcagaaacagactacgacgccgggtacaggttatgttgag 1050 ECBTUB 1051 gatggatatgatcaacgtaataccggcatctatctgaccgggctgcaaca 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 1051 gatggatatgatcaacgtaataccggcatctatctgaccgggctgcaaca 1100 ECBTUB 1101 agtcggcgattttacctttgaaggcgccag-acgcagtgacgataactca 1149 |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ECUW89 1101 agtcggcgattttacctttgaaggcg-cagcacgcagtgacgataactca 1149 ECBTUB 1150 cagtttggtcgtcatggaacctggcaaaccagcgccggttgggaattcat 1199 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 1150 cagtttggtcgtcatggaacctggcaaaccagcgccggttgggaattcat 1199 ECBTUB 1200 cgaaggttatcgcttcattgcttcctacgggacatcttataaggcaccaa 1249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 1200 cgaaggttatcgcttcattgcttcctacgggacatcttataaggcaccaa 1249 ECBTUB 1250 atctggggcaactgtatggcttctacggaaatccgaatctggacccggag 1299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 1250 atctggggcaactgtatggcttctacggaaatccgaatctggacccggag 1299 ECBTUB 1300 aaaagcaaacagtgggaaggcgcgtttgaaggcttaaccgctggggtgaa 1349 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 1300 aaaagcaaacagtgggaaggcgcgtttgaaggcttaaccgctggggtgaa 1349 ECBTUB 1350 ctggcgtatttccggatatcgtaacgatgtcagtgacttgatcgattatg 1399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 1350 ctggcgtatttccggatatcgtaacgatgtcagtgacttgatcgattatg 1399 ECBTUB 1400 atgatcacaccctgaaatattacaacgaagggaaagcgcggattaagggc 1449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 1400 atgatcacaccctgaaatattacaacgaagggaaagcgcggattaagggc 1449 ECBTUB 1450 gtcgaggcgaccgccaattttgataccggaccactgacgcatactgtgag 1499 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 1450 gtcgaggcgaccgccaattttgataccggaccactgacgcatactgtgag 1499 ECBTUB 1500 ttatgattatgtcgatgcgcgcaatgcgattaccgacacgccgttgttac 1549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 1500 ttatgattatgtcgatgcgcgcaatgcgattaccgacacgccgttgttac 1549 ECBTUB 1550 gccgtgctaaacagcaggtgaaataccagctcgactggcagttgtatgac 1599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 1550 gccgtgctaaacagcaggtgaaataccagctcgactggcagttgtatgac 1599 ECBTUB 1600 ttcgactggggtattacttatcagtatttaggcactcgctatgataagga 1649 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 1600 ttcgactggggtattacttatcagtatttaggcactcgctatgataagga 1649 ECBTUB 1650 ttactcatcttatccttatcaaaccgttaaaatgggcggtgtgagcttgt 1699 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 1650 ttactcatcttatccttatcaaaccgttaaaatgggcggtgtgagcttgt 1699 ECBTUB 1700 gggatcttgcggttgcgtatccggtcacctctcacctgacagttcgtggt 1749 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 1700 gggatcttgcggttgcgtatccggtcacctctcacctgacagttcgtggt 1749 ECBTUB 1750 aaaatagccaacctgttcgacaaagattatgagacagtctatggctacca 1799 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 1750 aaaatagccaacctgttcgacaaagattatgagacagtctatggctacca 1799 ECBTUB 1800 aactgcaggacgggaatacaccttgtctggcagctacaccttctga 1845 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ECUW89 1800 aactgcaggacgggaatacaccttgtctggcagctacaccttctga 1845 #--------------------------------------- #---------------------------------------