Аминокислоты, выделенные на рисунке, первые претенденты на образование водородной связи с лигандом.
Из них выбрал те, конфигурация атомов которых свидетельствует о наличие этой связи.
|
|
Далее я заметил, что Thr289 удерживает лиганд с одной стороны, и взаимодействующий атом распологается на значительном расстоянии от
остова, а значит,скорее всего, достаточно заменить этот остаток на, например, глицин, и физическое равновесие нарушится, а значит,
возможно, нарушится и способность связывания белка с лигандом.
|
|
Другой конец лиганда удерживает целая "кучка" аминокислотных остатков, а значит даже потеря одной связи в ней может не сказаться на
способности к связыванию, ну,к примеру, если заменить Asn57 на аспарагиновую кислоту,то , если учесть, что взаимодействующий атом кислорода в Asn57 имеет те же координаты,что и подобный
ему атом кислорода в аспарагиновой кислоте, связь и подавно не должна разрушиться.
|