Ралдугина Василиса

Студентка Факультета биоинженерии и биоинформатики

МГУ имени М.В. Ломоносова

Обо мне

Главная

Сайт ФББ МГУ

Краткое описание генома Banna virus strain JKT-6423

Вирус Банна (БАВ) является новым патогеном, который вызывает вирусный энцефалит человека

и был выделен из видов кровососущих насекомых и млекопитающих в Азии.

Тем не менее, нет никаких сообщений о систематических исследованиях, описывающих происхождение и эволюцию БАВ.

Геном вируса состоит из 12 сегментов двуцепоченой ДНК.

Филогенетический анализ BAVs показал, что вирус возник в начале 20-го века.

Генетические различия между штаммами BAV положительно коррелируют с географическим распределением.

Штаммы из одних и тех же широт почти на 100% идентичны, в то время как различия между штаммами в разных широтах могут быть> 60%.

Такие факторы, как глобальное потепление и увеличение перевозок могут в значительной степени способствовать распространению БАВ.

Результаты исследований показывают, что БАВ является новым вирусом на стадии,

которая включает в себя быстрое развитие и имеет большой потенциал для внедрения в неэндемичных районах. [1] .

В таблице изложены некоторые параметры вируса:

Таблица: Основные параметры генома Banna virus strain JKT-6423

Параметр

Значение

Английское название вируса

Banna virus strain JKT-6423

Русское название вируса

Банна вирус

Количество фрагментов в полном геноме

12

Общая длина генома (п.н.)

3747

Количество кодируемых в геноме полипептидов

1

Количество "зрелых" вирусных белков

30 


                     >NP_694469.1 
                     MDIQEQFEGYLREEVDLLNKFEDSHFKQLEVFYTNSQADHVINKDKAQFSDLPFHTTLYK
                     EVNGKRVKLGTLLNWTKAERLDTIRHESMIKDERLRRLIDFDYSWIDYAVVLQRYLDEGN
                     VIAPADILKFDSDFINNIKHPTEKNNFLDIKVIKECETYILMKDDNGIRDPDILRAWELD
                     SIPDVIELDVDGEVKKFNLRKEMIKRIQDEAPVYFFASVSLCSRNLDPNISEVKLWLEYF
                     IGSEDFFGFNGPNVVVSKSLLAAKRFEVVVNHLRKVAAFELDDESKEVMTEWLKYIMIDP
                     VYRSYKNRGAFGNLNQHVFARTKSEGLSWSLIDIGTTNFELKPTKKLAGSYVKKFNLVDD
                     VLVEESLKDLRNEGLYKMADITRRMIDADITPENVKKGKLNRLALSYCGYTGSHSATAMV
                     KQFNGTKDLDPNCDPMFVDIVKDNMKVYMQEGLQKYPHGSRKINRLDILFKGGTSSASST
                     NEHATVNGRFRYRSELYRERDVNSSTVFKTATAGQYRVVKKISAKLKSKNANIITHPMNF
                     INSKVSDLDVVVNAGSRLVRGTRAKRIITPNYGTIYAASLMTVLPAVRLLSSRASNMGAL
                     STQGSLVDRAPHDVMAPQLAVTSSDDVSKVCVAKDFGQFDTSQWGQISKAHADGVRSMKV
                     HYSMGHDALVDLDLNDASFADLLEVTAMSFEKPLKYKMNGLVCESAGVKSGELTTQTRNT
                     TTNISHSTVALDDYNNRAYRLNLPKLELVTDNKVGDDSVEVLRVVDGSPLTPEIAKLYVS
                     CMQDHADRNHLEISAKRTIVGNNVAEHIKIWVFKGYLALDVFLDSVTSEKNSFSNLNYLE
                     QVNILYDMAMTLMIRYCSVQACMTQFCNDMKLLNGIRAGNYTFIPTPKIICAYGTPEICL
                     RAPEIRSFGRYLPIDKDEYSVLNDLVASLSTNKPKMEFVSQMIEQNGNKVHSLWLDHFKR
                     KNDVNPNGGGIHISEGLKRLMPEYCEKHLNELVYKTLDDKVIRDYTSDIIISNICKGKLS
                     KAPKLAFYANFYLSLTNTNGVDSPYLTADEGVKNVHRVIGLSYRNTLSTSPTSNVDRILR
                     NNPGSAPAYLTGNDILGVLSDYPYQNWRTVVELLDITEPSATAIIEVATNQMHAYLADKD
                     LNTANLFDNTSRTYDISDRTYPKFVNITSSLSNSNRRGFQIEAMKHVIYMARRGVAVLAN
                     THPTKIGNTVYYDY

Источники:

[1] Elsevier B.V., Molecular evolution of emerging Banna virus

[2] NCBI

© Raldugina Vasilisa 2016