Ралдугина Василиса

Студентка Факультета биоинженерии и биоинформатики

МГУ имени М.В. Ломоносова

Обо мне

Главная

Сайт ФББ МГУ

Визуализация молекулы белка бактерии Planococcus sp. L10.15


Текст скрипта

В таблице содержатся значения некоторых водородных связей между остовными атомами азота и кислорода:

Параметры водородных связей между остовными
атомами во вторичной структуре*

№ Имена атомов Длина связи (Å) Угол N-O-C (°)
Альфа-спирали
1 N(191GLU)- O(187GLU) 2,97 146,5
2 N(192PHE)- O(188GLN) 2,79 156,2
3 N(193VAL)- O(189ILE) 3,06 156,0
Бета-тяжи
1 N(400ILE)- O(397ARG) 3,29 112,2
2 N(402ASP)- O(395SER) 2,97 143,9
3 N(397ARG)- O(400ILE) 2,75 164,5

Данные таблицы показывают структурные отличия альфа-спиралей и бета-тяжей в белке. Разброс данных в альфа-спирали небольшой, в отличие от данных бета-тяжей. Средняя длина связи - 2,94 А. Средний угол - 152,9 градуса. Для бета-тяжей: средняя длина связи - 3 А, средний угол - 140,2 градуса. Из различий в разбросе данный следует, что альфа-спирали более устойчивее, чем бета-тяжи. В них водородные связи образуют менее подвижные и более прочные структуры.

* Данные получены при помощи функций консоли программы "JMol".

© Raldugina Vasilisa 2016