Филогенетическое дерево

Ралдугина Василиса Студентка Факультета биоинженерии и биоинформатики МГУ имени М.В. Ломоносова
Обо мне	Семестры 1^st term 2^nd term 3^rd term 4^th term 5^th term 6^th term 7^th term 8^th term 9^th term 10^th term 11^th term 12^th term	Главная	Сайт ФББ МГУ

Филогенетическое дерево

Видовое название	Мнемоника	Таксономия
Serratia proteamaculans	SERP5	cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacterales; Yersiniaceae; Serratia
Proteus mirabilis	PROMH	cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacterales; Morganellaceae; Proteus
Saccharophagus degradans	SACD2	cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Cellvibrionales; Cellvibrionaceae; Saccharophagus
Pseudomonas mendocina	PSEMY	cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas; Pseudomonas aeruginosa group
Rhizobium meliloti	RHIME	cellular organisms; Bacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Rhizobiaceae; Sinorhizobium/Ensifer group; Sinorhizobium
Brucella suis	BRUSU	cellular organisms; Bacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Brucellaceae; Brucella
Neisseria meningitidis	NEIMA	cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Neisseriales; Neisseriaceae; Neisseria
Aromatoleum aromaticum	AROAE	cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Rhodocyclales; Rhodocyclaceae; Aromatoleum

Скобочная формула дерева

(((SERP5,PROMH),(SACD2,PSEMY)),(NEIMA,AROAE),(BRUSU,RHIME))

Рисунок 1. Филогенетическое дерево

Нетривиальные ветви	Название таксона	Таксон
{SERP5, PROMH} против {SACD2, PSEMY, NEIMA, AROAE, BRUSU, RHIME}	Enterobacterales	order
{SERP5, PROMH, SACD2, PSEMY, NEIMA, AROAE} против {BRUSU, RHIME}	Rhizobiales	order
{NEIMA, AROAE} против {SERP5, PROMH, SACD2, PSEMY, BRUSU, RHIME}	Betaproteobacteria	class
{NEIMA, AROAE, BRUSU, RHIME, SERP5, PROMH} против {SACD2, PSEMY}	Gammaproteobacteria	class

Деревья построенные разными способами

Правильное дерево	Дерево, построенное методом наибольшего правдоподобия

Правильное дерево	Дерево, построенное методом минимальной эволюции

Правильное дерево	Дерево, построенное методом Neighbor-Joining

© Raldugina Vasilisa 2016