Химическое строение нуклеиновых кислот.

• Построить цепь ДНК, состоящую из 4х нуклеотидов: T,C,A,G.

В программе Chemsketch с использованием набора заготовок (Template window) была построена цепь ДНК, состоящая из 4х нуклеотидов T,C,A,G. 

Тёмно красным цветом и более толстыми линиями выделены те связи, которые описывают ход сахаро-фосфатного остова. Также, пронумерованы атомы в изображении структуры пуриновых (A,G) и перемидиновых (C,T) оснований: основания присоединяются к дезоксирибозе через атом азота в 9 положении пурина и в 1 положении пиримидина.
Синим цветом обозначены 5' и 3' концы цепи ДНК.

Также с использованием набора заготовок было получено изображение дезоксирибозы. Атомы углерода пронумерованы.

• Построить химическую структуру уридина и псевдоуридина.

Псевдоуридин отличается отуридина тем, что гликозидная связь в псевдоуридине образуется через пятый атом C, а не через первый атом N, как в уридине.


Пронумерованы атомы в изображении оснований.

• Предсказать, какие водородные связи могут образовываться между пуриновыми (A,G) и перемидиновыми  (C,T) основаниями.

Будем считать, что донорами водорода являются группы NH2 и NH, а акцепторами водорода - атомы O и N, которые не связаны с водородом.
Для начала изобразим "канонические" так называемые пары оснований Уотсона-Крика.

Водородные связи на рисунке обозначены пунктиром синим цветом, основания подписаны.
Теперь изобразим "неканонические" пары оснований A-C. Будем рассматривать варианты с не меньше чем двумя водородными связями.
Неканонические пары оснований G-T.


Протокол к занятию.

---

Главная  Первый семестр  Второй семестр  Третий семестр