WELCOME MY FRIEND!

Состав записи 1fhv банка PDB

02-AUG-00   - дата публикации белка в PDB

OXIDOREDUCTASE  - заголовок структуры (фермент относится к классу оксидоредуктаз)

Название структуры - CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF O-SUCCINYLBENZOATE SYNTHASE FROM E. COLI COMPLEXED WITH MG AND OSB
говорит о том, что мы имеем дело с анализом кристаллической структуры белка О-сукцинилбензоат синтазы из E. COLI 
в комплексе с ионами магния и органическим лигандом OSB.

Белок состоит из одной А-цепи.

Вот и она!

Остовная модель цепи	Та же, окрашенная по структуре

На окрашеной цепи: 
розовым обозначены альфа-спирали
жёлтым - бета-складки
синим - бета-повороты
зелёным отмечены области, в которых одни и те же остатки имеют 2 варианта конформации - А и В

Но мне кажется более наглядной и симпатичной ленточная модель:

Некоторые количественные характеристики

Количество водородных связей.... 210
Количество альфа-спиралей................ 13
Количество бета-складок.................. 21
Количество бета-поворотов................ 29

Данные получены путём выполнения команд в программе RasMol:
restrict none
select *:A
structure

Таким образом, мой белок относится к типу "альфа-бета", т.е., как видно из наглядных изображений
и количественных характеристик, содержит как альфа-спирали, так и бета-структуры.

Обратимся теперь к составу лигандов.

	Краткое обозначение лиганда	Название	Русское название	Формула
1.	MG	MAGNESIUM ION	Ион магния	MG 2+
2.	OSB	O-SUCCINYLBENZOATE	О-сукцинилбензоат	C11 H10 O5
3.	HOH	Water	Вода	H2 O

Подробнее о белке
А также

К блоку
1й семестр
На главную