WELCOME MY FRIEND!


Контакты лиганда 2-SUCCINYLBENZOATE с белком О-сукцинилбензоат синтазой по данным записи 1fhv


Контактом будем считать расположение двух атомов на расстоянии менее 5 ангстрем друг от друга;
в программе RasMol это множество задаётся командой:
select protein and within(5.0, OSB)

Таблица остатков аминокислот, участвующих во взаимодействии с лигандом,
и их идентификаторов

Остаток Цепь Номер
LEU A 19
LEU A 48
PHE A 51
LYS A 131
ASP A 161
ASN A 163
GLU A 190
ASP A 213
VAL A 233
LYS A 235
SER A 262
SER A 263
SER A 264
ILE A 265
GLY A 288
LEU A 289
THR A 291


В левом верхнем углу 
изображена молекула лиганда OSB;
в двух других углах-
в разных ракурсах-
контакты ser263 с молекулой лиганда.





К блоку
1й семестр
На главную



© Шишкова Настя, 2008