WELCOME MY FRIEND!


Элемент вторичной структуры белка О-суцинилбензоат-синтазы


Одна из альфа-спиралей (56й - 70й аминокислотные остатки) моего белка:


RasMol: restrict 56-70:A
На модели альфа-спирали разным цветом показаны различные аминокислотные остатки.


Водородные связи между остовными атомами спирали:


  Для большей наглядности на первом изображении оставила только лишь остовные атомы азота и кислорода.
Кислород показан красным цветом, а азот - сиреневым. Водородные связи показаны пунктиром – красным ближе к атомам
кислорода, сиреневым – ближе к атомам азота. Номера остатков, к которым принадлежат атомы,
участвующие в таких водородных связях, отмечены жёлтым цветом. 
  
  Рядом изображение моей спирали, включающей, помимо остовных атомов азота и кислорода, и другие атомы остатков,
которые для наглядности меньшего диаметра и отмечены зелёным цветом.

  Анализируя имеющиеся изображения, можно вывести правило, которому удовлетворяют атомы, 
формирующие такие водородные связи. Парой каждому атому карбонильного кислорода из n- ного остатка является амидный 
азот из остатка(n + 4). Соответственно, в каждом остатке, начиная с 5го номера от начала и заканчивая 5м номером с конца 
моей спирали, находится по 2 остовных атома, образующих внутри неё водородные связи, один и которых амидный азот, 
а другой – карбонильный кислород.



К блоку
1й семестр
На главную



© Шишкова Настя, 2008