|
Лиганд (DEM) в окружении 5 аминокислотных остатков белка. Все молекулы подписаны. Голубыми шариками обозначены предположительно взаимодействующие атомы. |
(i) Аминокислотные остатки, контактирующие с децилоксиметанолом(DEM): pro103, leu36, leu87, leu89, arg31. Лиганд удерживается молекулой белка только за счет гидрофобных взаимодействий.
(ii) Пролин(pro103) можно заменить на любой гидрофильный остаток небольшого размера, например, на серин, тогда нарушается фундаментальное гидрофобное взаимодействие лиганд-белок
(iii) Лейцин(leu36) можно заменить на другой гидрофобный остаток не сильно отличающийся от исходного по количеству атомов в цепи, например, на его изомер-изолейцин. Остаток отлично входит в зону контакта и не нарушает гидрофобных взаимодействий
© Карпусь Ольга, 2004