Второй семестр
Банки данных Swiss-Prot и UniProt
Данные банка Swiss-Prot о белке RRF_ECOLI
Описание поля |
Метка поля (line code) |
Запись |
Внутренний уникальный постоянный идентификатор документа | AC | P16174 |
Стандартное имя последовательности (идентификатор последовательности) | ID | RRF_ECOLI |
Название белка, отражающее его функции | DE | Фактор освобождения рибосомы (Ribosome recycling factor, RRF) |
Дата создания документа | DT | 01-APR-1990 |
Дата последнего исправления аннотации | DT | 01-FEB-2005 |
Название организма | OS | Escherichia coli, Escherichia coli O6, Escherichia coli O157:H7 и Shigella flexneri |
Полное название таксона | OC | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia |
Длина последовательности | SQ | 185 а.о. |
Молекулярная масса белка | SQ | 20639 а.е.м |
Число публикаций, использованных при создании документа | RN | 15 |
Название журнала с самой свежей публикацией | RL | Infect.Immun.71:2775-2786(2003) |
Описание вторичной структуры | FT | Номера аминокислотных остатков начала и конца элементов вторичной структуры |
Что содержит поле комментариев? | CC | Темы: функции белка, нахождение в клетке, сходные элементы |
Какие особенности последовательности указаны? | FT | Указаны только альфа-спирали, бета-тяжи и повороты |
Идентификатор файла PDB | DR | 1EK8; 1ISE |
Документ, содержащий информацию о белке RRF_ECOLI можно получить в базе данных Swiss-Prot
Результаты поиска в БД UniProt белков с тем же кратким описанием (DE), что и у белка RRF_ECOLI
Поиск проводился в трех таксонах: Археи, Бактерии, Эукариоты с помощью поисковой системы SRS.
Таксон |
Запрос |
Количество найденных документов |
Археи (Archaea) | No entries found | 0 |
Бактерии (Bacteria) | ([uniprot-Taxonomy:Bacteria*] & ((([uniprot-Description:Ribosome*] & [uniprot-Description:recycling*]) & [uniprot-Description:factor*]) | [uniprot-Description:Ribosome recycling factor*])) | 192 |
Эукариоты (Eukaryota) | ([uniprot-Taxonomy:Eukaryota*] & ((([uniprot-Description:Ribosome*] & [uniprot-Description:recycling*]) & [uniprot-Description:factor*]) | [uniprot-Description:Ribosome recycling factor*])) | 20 |
© Карпусь Ольга, 2004