Второй семестр

Банки данных Swiss-Prot и UniProt

Данные банка Swiss-Prot о белке RRF_ECOLI

Описание поля

Метка поля (line code)

Запись

Внутренний уникальный постоянный идентификатор документа AC P16174
Стандартное имя последовательности (идентификатор последовательности) ID RRF_ECOLI
Название белка, отражающее его функции DE Фактор освобождения рибосомы (Ribosome recycling factor, RRF)
Дата создания документа DT 01-APR-1990
Дата последнего исправления аннотации DT 01-FEB-2005
Название организма OS Escherichia coli, Escherichia coli O6, Escherichia coli O157:H7 и Shigella flexneri
Полное название таксона OC Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia
Длина последовательности SQ 185 а.о.
Молекулярная масса белка SQ 20639 а.е.м
Число публикаций, использованных при создании документа RN 15
Название журнала с самой свежей публикацией RL Infect.Immun.71:2775-2786(2003)
Описание вторичной структуры FT Номера аминокислотных остатков начала и конца элементов вторичной структуры
Что содержит поле комментариев? CC Темы: функции белка, нахождение в клетке, сходные элементы
Какие особенности последовательности указаны? FT Указаны только альфа-спирали, бета-тяжи и повороты
Идентификатор файла PDB DR 1EK8; 1ISE

Документ, содержащий информацию о белке RRF_ECOLI можно получить в базе данных Swiss-Prot

Результаты поиска в БД UniProt белков с тем же кратким описанием (DE), что и у белка RRF_ECOLI

Поиск проводился в трех таксонах: Археи, Бактерии, Эукариоты с помощью поисковой системы SRS.

Таксон

Запрос

Количество найденных документов

Археи (Archaea) No entries found 0
Бактерии (Bacteria) ([uniprot-Taxonomy:Bacteria*] & ((([uniprot-Description:Ribosome*] & [uniprot-Description:recycling*]) & [uniprot-Description:factor*]) | [uniprot-Description:Ribosome recycling factor*])) 192
Эукариоты (Eukaryota) ([uniprot-Taxonomy:Eukaryota*] & ((([uniprot-Description:Ribosome*] & [uniprot-Description:recycling*]) & [uniprot-Description:factor*]) | [uniprot-Description:Ribosome recycling factor*])) 20


© Карпусь Ольга, 2004