Домены

Описание TnsA endonuclease C terminal

**Таблица 1 описание семейства доменов**
	Информация	Комментарии
AC pfam	PF08721
ID pfam	TnsA endonuclease C terminal
SEED	42
All	2k
SW	1
architectures	7
3D	2	Представлены структуры TnsA — одного из двух белков, составляющих Tn7 транспозазу, и TnsA, связанного с TnsC в комплекс. TnsA регулирует реакции расщепления ДНК на 5' концах транспозона Tn7. С-концевой домен TnsA содержит мотив "спираль-поворот-спираль", который обычно связывает ДНК. Однако в данном случае вместо связывания ДНК С-концевой домен TnsA вероятно обеспечивает белок-белковые взаимодействия с каталитическим N-концевым доменом транспозазы.
Taxonomy - eukaryota	1	Среди эукариот встречается только у Monosporascus sp. 5C6A — вида грибов семейства Diatrypaceae, отдел Ascomycota.
Taxonomy - archaea	1	Среди эукариот встречается только у Thorarchaeota archaeon (strain OWC), принадлежащего к группе Asgard.
Taxonomy - bacteria	2k	Домен наиболее распространен среди бактерий, в основном у гамма-протеобактерий.

Выравнивание seed

**Таблица 2 описание семейства доменов**
	Информация	Комментарии
Выравнивание seed	Число последовательностей — 42, число колонок — 90
Максимальный достоверный блок, включающие ВСЕ последовательности (МДБ-all)	Отсутсвует
100% консервативные колонки в МДБ-all	9:N
Максимальный достоверный блок, включающий НЕ ВСЕ последовательности. (МДБ-notAll)	Колонки 9-13, последовательности 1-38
100% консервативные колонки в МДБ-notAll	9:N, буквы сходных по свойствам а.к.о. в 13[ILM]"
Участок выравнивания, в котором нет никаких достоверных подблоков, и потому маловероятно, что выравнивание на этом участке отражает ход эволюции.

Проект Jalview

Карта локального сходства (dotplot)

Карта показывает разрыв, соответсвующий инделю на рис.1, ближе к C-концам. Также показаны гэпы и небольшие индели на протяжении всего выравнивания, но в целом последовательности схожи.

indel

Рис. 1 крупный индель в выравнивании последовательностей белков

Карта локального сходства двух белков

**Таблица 3 Карта локального сходства**
	Информация	Комментарии
Доменная архитектура 1	Tn7_TnsA-like_N, Tn7_Tnp_TnsA_C, Mu-transpos_C
Белок с архитектурой 1	C3GAE3
Доменная архитектура 2	Tn7_Tnp_TnsA_C, rve, Mu-transpos_C
Белок с архитектурой 2	A0A235HTU6