Задача – создать выборку белков, выполняющих ту же функцию, что Порин OmpF.
1.Краткое описание прототипа по данным банка аминокислотных последовательностей Swiss-Prot, release 28.02.04 |
---|
таблица в формате Word |
![]() |
Часть 2. Описание процедуры составления выборки |
Поиск я вел на сервере http://srs.ebi.ac.uk/.
|
Я отбирал белки по видам организмов и по функциям. то есть я брал лишь гомологов в заданных мне
№ | ID | AC | Организм | Таксон |
1 | OMPF_ECOLI | P02931 | ESCHERICHIA COLI | BACTERIA
PROTEOBACTERIA GAMMAPROTEOBACTERIA ENTEROBACTERIALES ENTEROBACTERIACEAE ESCHERICHIA |
2 | Q9ZC72 | Q9ZC72 | YERSINIA PESTIS | BACTERIA
PROTEOBACTERIA GAMMAPROTEOBACTERIA ENTEROBACTERIALES ENTEROBACTERIACEAE YERSINIA |
3 | Q9ZC71 | Q9ZC71 | YERSINIA PESTIS | BACTERIA
PROTEOBACTERIA GAMMAPROTEOBACTERIA ENTEROBACTERIALES ENTEROBACTERIACEAE YERSINIA |
4 | Q93K98 | Q93K98 | ENTEROBACTER CLOACAE | BACTERIA
PROTEOBACTERIA GAMMAPROTEOBACTERIA ENTEROBACTERIALES ENTEROBACTERIACEAE ENTEROBACTER |
5 | Q8X7L5 | Q8X7L5 | ESCHERICHIA COLI | BACTERIA
PROTEOBACTERIA GAMMAPROTEOBACTERIA ENTEROBACTERIALES ENTEROBACTERIACEAE ESCHERICHIA |
6 | Q8X731 | Q8X731 | ESCHERICHIA COLI | BACTERIA
PROTEOBACTERIA GAMMAPROTEOBACTERIA ENTEROBACTERIALES ENTEROBACTERIACEAE ESCHERICHIA |