Практикум 3,4

Общая характеристика

Макромолекула 7FRT является нерецепторной протеин-тирозиновой фосфатазой 1-го типа,которая участвует в регуляции сигнальных путей. Молекула представляет собой белковый комплекс с одной полимерной цепью (А-цепь), которая является самостоятельной биологической единицей. Структура была получена при помощи метода дифракции рентгеновских лучей.

Структура в целом

Тип макромолекулы – белок (гидролаза)

Молекула состоит из одной полимерной А-цепи

Биологическая единица состоит из одной А-цепи (мономер)

На рисунке номер 2 выделены элементы вторичной структуры белка: спирали - розовым, тяжи - голубым, а петли - зеленым. В молекуле примерно одинаковое количество спиралей и тяжей.

Отдельные цепи

Организм : Homo sapiens

Uniprot_id: P18031

Название: Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1

Функция: Действует как регулятор реакции эндоплазматического ретикулума на развёртывание белка. Опосредует дефосфорилирование EIF2AK3/PERK, инактивируя протеинкиназную активность EIF2AK3/PERK. Может играть важную роль в каскадах передачи сигналов, индуцированных CKII и p60c-src. Может регулировать сигнальный путь EFNA5-EPHA3, который модулирует реорганизацию клеток и межклеточное отталкивание. Также может регулировать сигнальный путь рецептора фактора роста гепатоцитов посредством дефосфорилирования MET

Мутации относительно референса из Uniprot
2 мутации: на 32 позиции вместо цистеина – серин; на 92 позиции вместо цистеина - валин

Модифицированных аминокислотных остатков в молекуле нет

Малые молекулы

Краткое наименование: TRS

Полное наименование: 2-Amino-2-hydroxymethyl-propane-1,3-diol

Файл с атомами малой молекулы TRS