Карта Рамачандрана

1. Определение торсионных углов φ, ψ и ω аминокислотного остатка GLU10 цепи А белка 1XCO.

Название двугранного угла	Угол определяется по координатам атомов	Данный угол описывает поворот вокруг связи	Результат измерения с помощью RasMol
φ	GLN9:A.C (карбонильный углерод 9-го остатка цепи А) GLU10:A.C (карбонильный углерод 10-го остатка цепи А) GLU10:A.CA (альфа-углерод 10-го остатка цепи А) GLU10:A.N (азот 10-го остатка цепи А)	Cαi — Ni	-66.47
ψ	GLU10:A.N (азот 10-го остатка цепи А) GLU10:A.CA (карбонильный углерод 10-го остатка цепи А) GLU10:A.C (альфа-углерод 10-го остатка цепи А) LYS11:A.N (азот 11-го остатка цепи А)	Cαi — Ci	-43.85
ω	GLU10:A.CA (альфа-углерод 10-го остатка цепи А) GLU10:A.C (карбонильный углерод 10-го остатка цепи А) LYS11:A.N (азот 11-го остатка цепи А) LYS11:A.CA (альфа-углерод 11-го остатка цепи А)	Ci— Ni+1	-179.11

2. Схема построения углов:

φ

ψ

ω

Скрипт можно скачать здесь

3. Карты Рамачандрана.

Карта Рамачандрана для всего белка, пролина и глицина По оси абсцисс отложаны углы φ, по оси ординат углы ψ.

Карта Рамачандрана для α-спиралей и β-листов По оси абсцисс отложаны углы ψ, по оси ординат углы φ.

Excel файл можно скачать здесь