Эволюционные домены.

1. Описание доменной архитектуры белка PTAS_BACSU в соответствии с банком Pfam

Заходим на главную страницу Pfam, в поле "JUMP TO" ищем белок по его ID(в моем случае ID: PTAS_BACSU).

Доменная структура белка PTAS_BACSU по данным Pfam.

Схема из Pfam:
Пояснения к схеме
Pfam AC Pfam ID Полное название семейства доменов Положение в последовательности белка PTAS_BACSU Клан
1. PF01515 PTA_PTB Ацетил/бутарил фосфат трансферазы, катализирующие перенос ацетила или бутарила в группу ортофосфатов. 3-319 Клан Iso DH(CL0270) содержит 5 семейств, функции всех семейств известны.

2. Описание домена PTA_PTB белка PTAS_BACSU.

3. Описание доменной архитектуры, в которой присутствует два или более разных домена.

Так как белок PTAS_BACSU содержит только один домен, то выберем одну из предствленных 19 доменных архитектур, в которые входит домен PTA_PTB, например malic, Malic_M, PTA_PTB.
Изображение архитектуры:


© Butusova Anna,2011