Смоделируем ситуацию, когда на отрезке [0,30] расположены две молекулы, состоящие из 5 атомов. Атомы связаны ковелентно и находятся на расстоянии 1-1.5 Å друг от друга, а молекулы - примерно 5Å. Электронные плотности атомов описываются гаусовской кривой. Максимум электронной плотности в центре атома примерно пропорционален числу электронов в атоме.
Для создания функции электронной плотности атомов использовался скрипт compile-func.py cо значениями max в точках 4.3, 16, 6, 25, 13; высотой 27, 15, 7, 2.
Итогом работы скрипта является текстовый файл.
Рис.1: График заданной функции ЭП |
Получить полных набор гармоник можно:
Рис.2: График восстановленной функции ЭП для n=13, изображенная красным, и исходная функция - черным. | |
Рис.3: График восстановленной функции ЭП для n=26, изображенная красным, и исходная функция - черным. | |
Рис.4: График восстановленной функции ЭП для n=39 | |
Рис.5: График восстановленной функции ЭП для n=52 |
Значение n0 было определено 52. Восстановление для n= 13 и n=26 можно определить как "среднее" ( положение 3х из 5 атомов можно определить); n= 39 и n=52 - "отличное" восстановление, так как можно определить положение максимумов всех атомов (изображения для сравнения исходной функции и восстановленной для 39 и 52).
К полученным результатам добавлялось 48% шума к амплитуде и 14% к фазе и восстановление функции проводили по полному набору гармоние 0 - n0.
Рис.6: График восстановленной функции ЭП c 48%-ным уровнем шума амплитуды, изображенная красным, и исходная функция - черным. | |
Рис.7: График восстановленной функции ЭП c 14%-ным уровнем шума фазы, изображенная красным, и исходная функция - черным. | |
Рис.8: График восстановленной функции ЭП c 48%-ным уровнем шума амплитуды и 14% уровнем шума фазы. |
Как и следовало ожидать, высокий уровень шума, добаленный к амплитуде, ухудшает уровень восстановления с "отличного", до "плохого", так как после изменений уже невозможно различить не только расположение атомов, но даже их количество.Такой же результат был получен и для случая шума фазы, если же рассматривать исход эксперимента с шумом и амплитуды и фазы, то, возможно, интерпретация этих данных будет невозможна без дополнительных манипуляций.
Чтобы получить неполных набор гармоник удалили одну и две начальные гармоники (1-52; 2-52).
Рис.9: График восстановленной функции ЭП с удаленной 0-ой гармоники изображен красным, а исходная функция - черным. |
При удалении первой гармоники (0-ой) восстановленная функция имеет "отличный" результат восстановления, однако параллельно сдвинутый вниз по оси ординат. Данный исход объясняется тем, что первый член ряда фурье ( первая гармоника) отвечает за сдвиг графика.
Рис.10: График восстановленной функции ЭП с удаленной 0-ой и 1-ой гармоники, изображен красным, а исходная функция - черным. |
При удалении первых двух гармоник восстановление функции также имеет "отличную" оченку, однако наблюдается выгиб в центральной части.
Другим способом получить неполный набор гармоник является удаление гармоник из середины наборы, а именно удаление 5-10% от полного набора. Для получения были сначала удалены 25 и 28 гармоники; 23,26 и 31 гармоники; и с 23 по 28.
Рис.11: График восстановленной функции ЭП с удаленными 25 и 28 гармониками, изображенная красным, и исходная функция - черным. |
Рис.12: График восстановленной функции ЭП с удаленными 23, 26 и 31 гармониками, изображенная красным, и исходная функция - черным. |
Рис.13: График восстановленной функции ЭП с удаленными с 23 по 28 гармониками, изображенная красным, и исходная функция - черным. |
Чем больше гармоник было удалено в середине набора, тем хуже качество восстановления функции ЭП по сравнению с исходной функцией. Следовательно, при исключении гармоник в середине набора шум начинает приближается по значениям к максимумам функций, что затрудняет описание.
Если удалить гармонику с номером n0+10, то есть 62, то значительного ухудшения или улучшения не наблюдается.
Рис.14:График восстановленной функции ЭП с добавленной 62 гармоникой. |
По результатам проделанной работы можно полностью заполнить таблицу:
Набор гармоник | Разрешение,(Å) | Полнота данных,(%) | Шум амплитуды,(% от величины F) | Шум фазыб(% от величины phi) | Качество восстановления,(отличное, хорошее, среднее, плохое) | |
Полный набор гармоник | ||||||
0-13 | 2.3< /td> | 100 | 0 | 0 | среднее | |
0-26 | 1.15 | 100 | 0 | 0 | среднее | |
0-39 | 0.77 | 100 | 0 | 0 | отличное | |
0-52 | 0.58 | 100 | 0 | 0 | отличное | |
0-52 | 0.58 | 100 | 48 | 0 | плохое | |
0-52 | 0.58 | 100 | 0 | 14 | плохое | |
0-52 | 0.58 | 100 | 48 | 14 | плохое | |
Неполный набор гармоник | ||||||
1-52 | 0.58 | 98 | 0 | 0 | отличное | |
2-52 | 0.58 | 96.15 | 0 | 0 | хорошое | |
0-24,26-27,29-52 | 0.58 | 96.15 | 0 | 0 | среднее | |
0-22,24-25,27-30,32-52 | 0.58 | 94.23 | 0 | 0 | плохое | |
0-22,29-52 | 0.58 | 88.46 | 0 | 0 | плохое | |
0-52,62 | 0.58 | 100 | 0 | 0 | отличное |
© Butusova Anna,2014