В данном практикуме мы познакомились с такой программой, как MarvinSketch. Данная программа предназначена для быстрого, удобного и точного построения химических формул.
Примеры изображения нуклеотидов и нуклеиновых кислот
В данном задании необходимо было нарисовать 2'-дезоксигуанозиндифосфат, 2'-дезокситимидинмонофосфат, уридин и псевдоуридин,
а также пронумеровать атомы азотистых оснований и сахара и выделить атомы, связанные N-гликозидной связью
(файл).
Как видно из приведённого рисунка, у Псевдоуридина отсутствует N-гликозидная связь.
Рис. 1. Нуклеозиды и псевдоуридин (С-гликозид)
Затем необходимо было воспроизвести изображение фрагмента двухцепочечной ДНК
(файл).
Пунктиром показаны водородные связи в канонических парах. Направления цепей показаны стрелками. Азотистые основания подписаны.
Сахаро-фосфатный остов выделен лазурным цветом.
Рис.2 Фрагмент двухцепочечной ДНК