Практикум №12

KEGG, Reactome, Enrichr, MSigDB, Genome Browser, GeneCards

Метаболические пути.

1. ID - 00053. Метаболизм аскорбата (соли аскорбиновой кислоты) и aldarate (это от кислот, которые получаются окислением альдоз). P.S. картинка пути всё равно есть ниже.

3. Реакция R02957. D-Глюкуронолактон окисляется NAD+ и превращается в D-Глукарат.

4. Данную реакцию катализируют Оксиредуктазы, которые взаимодействуют с альдегидной группой или оксо-группой (NAD+ - акцептор). В частности альдегиддегидрогеназа катализирует эту реакцию.

5. Её код - 1.2.1.3. 1 - Оксиредуктаза, 1.2 - взаимодействие с альдегидной группой или оксо-группой, 1.2.1 - NAD+ или NADP+ - акцептор, 1.2.1.3 - альдегиддегидрогеназа (NAD+).

6. Я выбрал Homo sapiens (human) и Papaver somniferum (opium poppy)

Human - сверху, Opium poppy - снизу.

7. Для Papaver somniferum - 63018 белок-кодирующих генов, 3176 - РНК-кодирующих генов, 1271 метаболических путей (ссылка).