Аргининосукцинатсинтетаза

(argininosuccinate synthetase)

• Краткое название белка: ASSY_ECOLI
• Полное название организма: Escherichia coli, K-12
• Название гена:argG
• Номер локуса в бактериальной хромосоме:b3172
• Последовательность в формате FASTA

  >ASSY_ECOLI MTTILKHLPVGQRIGIAFSGGLDTSAALLWMRQKGAVPYAYTANLGQPDEEDYDAIP RRAMEYGAENARLIDCRKQLVAEGIAAIQCGAFHNTTGGLTYFNTTPLGRAVTGTML VAAMKEDGVNIWGDGSTYKGNDIERFYRYGLLTNAELQIYKPWLDTDFIDELGGRHE MSEFMIACGFDYKMSVEKAYSTDSNMLGATHEAKDLEYLNSSVKIVNPIMGVKFWDE SVKIPAEEVTVRFEQGHPVALNGKTFSDDVEMMLEANRIGGRHGLGMSDQIENRIIE AKSRGIYEAPGMALLHIAYERLLTGIHNEDTIEQYHAHGRQLGRLLYQGRWFDSQAL MLRDSLQRWVASQITGEVTLELRRGNDYSILNTVSENLTYKPERLTMEKGDSVFSPD DRIGQLTMRNLDITDTREKLFGYAKTGLLSSSAASGVPQVENLENKGQ

  Мои вычисления с помощью Excel.

  Аминокислотный состав A (аланин) 0,078 C (цистеин) 0,007 D (аспарагиновая кислота) 0,06 E (глутаминовая кислота) 0,076 F (фенилаланин) 0,03 G (глицин) 0,096 H (гистидин) 0,022 I (изолейцин) 0,06 K (лизин) 0,043 L (лейцин) 0,096 M (метионин) 0,04 N (аспарагин) 0,044 P (пролин) 0,03 Q (глутамин) 0,04 R (аргинин) 0,06 S (серин) 0,05 T (треонин) 0,065 V (валин) 0,05 W (триптофан) 0,013 Y (тирозин) 0,04

  Длина последовательности: 447а.о. Молярная масса: 49864,14 г/моль. (Mолекулярная масса белка равна суммарной молекулярной массе всех аминокислот за вычетом молекулярной массы воды, отщепившейся в ходе образования пептидных связей-на каждую связь по молекуле.В белке ASSY_ECOLI 447 а.о.,т.е 446 связей-вычитаем молекулярную массу 446 молекул воды). Средний электрический заряд белка ASSY_ECOLI: при pH=1 +56e при pH=7 –14e при pH=8 –16e Относительное содержание гидрофобных и гидрофильных аминокислотных остатков: в белке ASSY_ECOLI- 0,893 в протеоме Escherichia coli К-12- 1,1 в транспортных белках класса TC.2.A.- 7,37 Данный параметр показывает отношение количества гидрофобных аминокислотных остатков в белке к гидрофильным, то есть свойства данного белка по отношению к к воде(гидрофобность/гидрофильность). Сравнение трех вышеперечисленных параметров приводит в следующим основным выводам: 1.По отношению к воде белок ASSY_ECOLI приблизительно нейтрален,как и протеом в общем(то есть не обогащен в большой степени ни гидрофобными,ни гидрофильными остатками). 2.По сравнению с транспортными белками белок ASSY_ECOLI значительно менее гидрофобен (менее обогащен гидрофобными амимнокислотными остатками), значит с большой долей вероятности можно утверждать, что аргининосукцинатсинтетаза не яляется интегральным мембранным белком и выполняет свои фунции в значительно более обводненной среде,нежели липидный бислой биомембраны.

  ---

  ©Трембицкая Влада