Выравнивания. Работа с программой GeneDoc.

На главную страницу второго семестра
    1.Построение выравнивания двух коротких искусственных последовательностей.
 Сначала, с помощью редактора FAR был создан в рабочей директории 
файл first_aln.txt, в нем - выравнивание двух последовательностей.
 Так же по заданию, я взяла первые 60 букв из последовательности своего белка, а 
в качестве второй был дан  искусственно измененный  вариант последовательности 
моего белка.first_aln.txt 
   2.Вычисление "веса" выравнивания. 
    Я добавила к выравниванию, полученному при выполнении 
 предыдущего задания, третью строчку, содержащую следующие символы: 
 звездочку *, если буквы в данной позиции совпали, точку, если они разные, 
 и минус -, если одна из последовательностей содержит гэп.  
 
   3.Построение выравнивания двух реальных последовательностей.
 С помощью редактора GeneDoc  я построила выравнивание 
аминокислотных последовательностей белка ASSY_ECOLI и Vibrio cholerae.  
Результат был сохранен в файле second_aln.msf 
в формате MSF.second_aln.msf
   Таким же образом было постоено выравнивание аминокислотных последовательностей
белка ASSY_ECOLI и Yersinia pestis.second_aln1.msf