ACD ChemSketch

Mnev_Pr9.sk2 (файл в формате .sk2)

Упражнение 1. Аминокислота Лизин белка thiS

Структурные формулы (плоская формула Лизина, формулы для L- и D- изомеров Лизина) для 13-ой аминокислоты (Лизин, Lys, K) моего белка:

3amin

Упражнение 2. Пространственная структура L- и D- форм аминокислоты Лизин


L-изомер	D-изомер

В конце 19 века Эмиль Фишер занимался химией углеводов. Им впервые был осуществлен синтез ряда природных сахаров. В качестве исходного вещества Фишер использовал простейший углевод – глицериновый альдегид, и при помощи так называемого циангидринового синтеза наращивал углеродную цепочку, пока не получал соединения с формулой C6H12O6.

Глицериновый альдегид содержит один асимметричный атом углерода, то есть один потенциальный центр оптической изомерии, и, соответственно, существует в виде двух оптических изомеров. Правовращающий изомер Фишер обозначил буквой D, а левовращающий – буквой L. Углеводы, полученные из D-изомера глицеринового альдегида, были отнесены им D-ряду, и такой же ряд углеводов, но обозначенных индексом L, был получен из L-изомера.

Предложенная Фишером DL-номенклатура по сей день широко применяется для обозначения оптических изомеров углеводов и аминокислот. Все природные углеводы принадлежат к D-ряду, а все природные аминокислоты – к L-ряду.

(источник)

Изомеры различаются по взаимному расположению атома водорода и радикала.
У L-изомера: из плоскости (N-Cа-C) выходят атом водорода и радикал. Атом водорода смотрит на нас, радикал - от нас.
У D-изомера: атом водорода от нас, радикал - на нас.

Упражнение 3. Химическая реакция образования дипептида лейцилглутамина.

Упражнение 4. Схема трипептида метиониллейцилглутамина.

Ниже приведена формула трипептида, состоящего из первой, второй и третьей аминокислот моего белка.

3peptid

Дополнительное задание: Формула фикоцианобилина.

формула фикоцианобилина