Vulcanisaeta moutnovskia 768-28

  • Латинское название: Vulcanisaeta moutnovskia 768-28
  • Домен: Архея
  • Vulcanisaeta - анаэробная, гетеротрофная, гипертермофильная архея. Оптимальные условия для роста: температура - 85-90°С, рН - 4.0-4.5. Обитает в серных и горячих источниках восточной Японии.
  • Идентификатор записи в базе данных RefSeq на сайте NCBI: NC_015151
  • Содержание записи: полный геном хромосомы; кольцевая ДНК.
  • Длина полного генома: 2298983bp

    Окружение гена гипотетического белка в геноме археи

   Рис1. Ген(VMUT_0270) и несколько соседних генов.
 
   Описание генов:

    Изучаемый:
  • VMUT_0270: длина 1269bp; направление +1; кодирует hypothetical protein, длиной 422 аминокислотных остатка.
    Соседние:
  • VMUT_0269: длина 912bp; направление -1; рамка считывания -1; расстояние до VMUT_0270 - 122bp; кодирует Proliferating cell nuclear antigen, длиной 303 аминокислотных остатка.
  • VMUT_0271: длина 768bp; направление -1; рамка считывания -0; расстояние до VMUT_0270 - 172bp; кодирует HAD-superfamily hydrolase, длиной 255 аминокислотных остатков.

   Ген и его соседи не могут входить в один оперон, так как находятся на разных цепях. В 3' направлении близайший ген на комплементарной цепи находится на расстоянии одного гена. В 5' направлении ближайший ген на комплементарный цепи находится так же на расстоянии одного гена.



© Горбатенко Владислав 2014