Изыскания в базе данных Protein Atlas
Я выбрал для исследования белок с идентификатором HEXA и базу данных Human Protein Atlas. Выдача при поиске по базе данных представляет собой таблицу, из которой можно выяснить функции белка в организме человека.
Мой белок представляет собой α-субъединицу гексозаминидазы, гидролизующей невосстанавливающий конец N-ацетилгексозаминов глюкоконъюгатов
Тканеспецифичность белка низкая, однако он может быть отнесён к кластеру, экспрессирующемуся в макрофагах (хотя его экспрессия прослеживается во многих типах клеток). Экспрессия его в клетках Хофбауэра (макрофагах плаценты) выше, чем в других типах клеток. Внутриклеточная локализация - цитозоль и лизосомы
Анализ датасета из 541 женщины из США, болеющей раком эндометрия. По распределениям вверху картинки видно, что экспрессия белка в выживших людях в среднем выше, чем в погибших (то есть высокая экспрессия белка даёт более благоприятный прогноз, его можно считать онкосупрессором)
К сожалению, из-за скрина изображение зашакалилось. Можно ознакомиться с оригинальной картинкой по ссылке