ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА
Тип макромолекул: белок, полипептидные цепи. Аннотация: MurE (UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate—2,6-diaminopimelate ligase), EC 6.3.2.13.
Полимерные цепи: в структуре 4 белковые цепи A, B, C, D.
Идентичность последовательностей: по SEQRES каждая цепь содержит 535 остатков. Последовательности A, B, C, D идентичны.
Биологическая единица: мономер. В записи указаны четыре сборки биомолекул, каждая соответствует одной цепи.
ОТДЕЛЬНЫЕ ЦЕПИ A B C D
Сведения одинаковы для всех цепей, так как они эквивалентны по последовательности и аннотации.
Организм - Mycobacterium tuberculosis, штамм H37Rv.
- UniProtKB: P9WJL3
- Название: MurE, UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide synthetase
- Функция: катализирует присоединение meso-диаминопимелиновой кислоты к UDP-MurNAc-L-Ala-D-Glu в цитозольных стадиях биосинтеза пептидогликана.
Мутаций относительно референса UniProt не заявлено.
Модифицированные остатки
Присутствует KCX карбоксилированный лизин. В каждой цепи модификация в позиции 262: KCX A 262, KCX B 262, KCX C 262, KCX D 262.
МАЛЫЕ МОЛЕКУЛЫ
В файле структуры встречаются три типа неполимерных объектов. KCX относится к модифицированным аминокислотам. В качестве малых молекул учитываются UAG и MG.
Список
- UAG uridine-5'-diphosphate-N-acetylmuramoyl-L-alanine-D-glutamate
- MG magnesium ion
Роль
UAG: функционально релевантный лиганд, отражающий связывание предшественника пептидогликана в активном центре MurE.
Mg2+: координационный ион, характерный для ATP-зависимых лигаз, участвует в организации каталитического узла и связывании реакционных компонентов.
KCX: химическая модификация лизина, оформлена как MODRES и присутствует во всех цепях.
ВЫВОДЫ
Структура 2WTZ представляет MurE из Mycobacterium tuberculosis в мономерной биологической форме. В кристалле наблюдаются четыре идентичные цепи. Активный центр связан с UAG и Mg2+. В структуре фиксирован карбоксилированный лизин KCX в позиции 262 во всех цепях.