Учебный сайт Вероники Мурашка
Практикум 3
Задание 1
Чтобы изобразить A-, B-, Z-формы ДНК я использовала программу fiber пакета 3DNA. Результаты можно загрузить по ссылкам:
Задание 2
Для гуанина я определила, в сторону какой бороздки обращены его атомы в каждой из 3-х структур ДНК.
| Направлены в сторону большой бороздки | Направлены в сторону малой бороздки | |
|---|---|---|
| A-форма | N2, N3, N9, C2, C4 | N7, O6, C5, C6, C8 |
| B-форма | N7, O6, C5, C6, C8 | N2, N3, N9, C2, C4 |
| Z-форма | N7, O6, C5, C6, C8 | N2, N3, N9, C2, C4 |
_____
Также я рассмотрела три формы ДНК и сравнила их по нескольким характеристикам; результаты приведены в таблице.
| A-форма | B-форма | Z-форма | |
|---|---|---|---|
| Тип спирали | правая | правая | левая |
| Шаг спирали (Å) | 28,1 | 33,8 | 42,8 |
| Число оснований на виток | 11 | 10 | 12 |
| Ширина большой бороздки | 11,2 (A/DG`5/P - B/DC`4/P) |
18,5 (B/DC`15/P - A/DT`7/P) |
7,2 (A/DG`5/P - B/DG`19/P) |
| Ширина малой бороздки | 14,9 (B/DC`4/P - A/DG`14/P) |
8,9 (A/DG`10/P - B/DT`19/P) |
16,1 (A/DC`4/P - B/DC`16/P) |
Задание 3
Стебли:
Неканонический пары:
Стабилизирующие связи: