BLAST
Характеристики списка находок и изменение длины слова
Был произведён поиск программой BLAST для мнимого периплазменного железосвязывающемого белка (ANS42615.1).
| Длина слова |
6 |
2 |
2 |
| Ограничение числа находок |
50 |
50 |
100 |
| Всего находок |
35 |
50 |
52 |
| Находок с E-value < 0,001 |
32 |
39 |
39 |
| Максимальное E-value |
0.12 |
7.5 |
8.2 |
Изменение объёма поиска
Выбранный таксон: Chlamydiae
E-value = 1e-14
E-value "ограниченного" поиска = 8e-17
E-value "ограниченного" поиска уменьшился, так как уменьшились размеры банка, из которого взяты последовательности. Вес выравнивания не изменился, так как не зависит от размеров банка.
|