На картинке изображены молекулы NLG и Val122, Leu65 в вандерваальсовой модели.
Хочется отметить, что ацетильный радикал при аминогруппе субстрата довольно плотно примыкает к боковым группам аминокислот Val и Leu.
Даже учитывая тепловые флуктации (связанные с молекулярной динамикой), которые в молекуле белка приводят к смещениям атомов относительно друг друга, но не более чем 2-3Å, можно с уверенностью заявить, что эти остатки (Val, Leu) создают субстратную специфичность фермента к ацилированному глутамину.