На страницу Ligand.html

Изображение контакта ADP с LYS 217A и LYS 8A.







РИС.1 Демонстрация гидрофильных взаимодействий ADP с Lys 217A(иначе Lys1) и Lys 8.
На картинке изображены молекулы ADP и Lys 217, Lys 8 в проволочной модели.
Голубым показан углеродный остов ADP, оранжевым — атомы фосфора в нуклеотиддифосфате. Желтым показан "важный" лизин: Lys217, серым: Lys8.
Отмечено наличие водяного мостика между NH2–группами лизинов и кислородом β–фосфорного остатка.
Также хочу обратить ваше внимание на наличие замкнутого кольца между молекулами воды и NH2–группой Lys1.
Замыкание кольца, тем более семичленного, позволяет стабилизировать связь Lys с ADP на несколько (порядка 2 кДж/моль)







©Володя Рудько