Мотивы в белке ARGB_ECOLI, описанные в БД Prosite.

Табл.1 Результаты выполнения задания.

Идентификатор документа PROSITE (AC)..	Название мотива.	Краткое описание мотива.	Тип подписи (паттерн, профиль).	Паттерн (регулярное выражение).	Специфичность подписи.	Количество найденных мотивов в белке.
PS00006	CK2_PHOSPHO_SITE	Сайт фосфорилирования казеинкиназой II	паттерн.	[ST]-x(2)-[DE]	неспецифична	3
PS00008	MYRISTYL	Сайт N-миристоилирования	паттерн	G-{EDRKHPFYW}-x(2)-[STAGCN]-{P}	неспецифична	6
PS00001	ASN_GLYCOSYLATION	Cайт N-гликозилирования	паттерн	N-{P}-[ST]-{P}	неспецифична	1
PS00005	PKC_PHOSPHO_SITE	Cайт фосфорилирования протеинкиназой C	паттерн	[ST]-x-[RK]	неспецифична	3

*Комментарии
Для нахождения мотивов в белке ARGB_ECOLI я проделал следующие операции. Последовательность своего белка внес в поле для сканирования PROSITE в БД на наличие мотивов. В результате работы программы был получен результат: найдено 13 мотивов, принадлежащих четырем паттернам, приведенным выше в таблице. Для заполнения всех полей таблицы, я переходил на соответствующие ссылки аннотации этих паттернов, где, совершив над собой огромное усилие ради перевода необъятного английского текста во имя великой цели, получил недостающую информацию!! С точки зрения важности результатов поиска могу сказать одно: все найденные паттерны неспецифичны, и ни один из них не попал на значимые участки белка (активный сайт, субстрат-связывающий сайт и др.), поэтому, я считаю, делать определенные выводы из этого не стоит. Действительно, полагаясь на данные о неспецифичных паттернах в ARGB_ECOLI можно думать, что этот белок вмногом проявляет свойства мембранного белка, или липопротеина, завязанного с гликозидным остатком и выполняющим определенную рецепторную функцию. В самом деле, в белке найдены паттерны N-гликозилирования и сайт N-миристоилирования, которые свойственны для выше обозначенных белков. Но так как мой белок по описанию не проявляет этих свойств. К тому же протеинкиназы C в прокариотической клетке ни как не может быть!!! Протеинкиназа С - целевой фермент "усилительного" ряда вторичных мессенджеров, который активируется посредством системы ИТФ/ДАГ: специфический гормон или фактор роста, связываясь с рецептором клетки, активирует фосфолипазу, расположенной с внутреней стороны мембраны, которая расщепляет диацилфофсфоинозитолглицерат на трифосфоинозитол (ИТФ) (растворимая компонента, активирует Ca²⁺-каналы) и диацилглицерол (ДАГ), который воздействует на протеинкиназу С. В свою очередь протеинкиназа С фосфорилирует определенные белки синтеза различных метаболитов клетки (зачастую секреторных), а также по-моему эта система есть в клетках гладкой мускулатуры, окружающих стенки сосудов, при стимуляции у которых адренергических рецепторов происходит сокращение сосудов. Также отмечена важная роль этой системы при синтезе лютеинизирующего гормона (ЛГ) клетками гипофиза и в прохождении клеточного цикла при воздействии гормонов роста (как это есть в эпителиоцитах).