НА ГЛАВНУЮ

InterPro

Документ InterPro IPR011576

Подписи, на основе которых был создан документ:
 
База
данных
Идентификатор
БД
Имя
подписи
Число
белков
Pfam PF01243 Pyridox_oxidase 476

 
Дерево родства подписей (жёлтым выделена рассматриваемая подпись):

IPR009002 : FMN-binding split barrel FOUND IN : (IPR007386 : Protein of unknown function DUF447)
IPR002563 : Flavin reductase-like, FMN-binding FOUND IN : (IPR011982 : 4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component)
IPR011576 : Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding FOUND IN : (IPR000659 : Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase, IPR012349 : Pyridoxamine 5-phosphate oxidase, FMN-binding)
IPR012350 : FMN-bp, FMN-binding
IPR012349 : Pyridoxamine 5-phosphate oxidase, FMN-binding CONTAINS: (IPR011576 : Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding) FOUND IN: (IPR000659 : Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase)

Описание известных подписей в белке PDXH_ECOLI

Название
подписи
Идентифи-
катор
InterPro
Положение в последовательности PDXH_ECOLI Идентифи-
катор БД
Название базы данных Организация, поддерживающая БД Город и страна
Pyridox_
oxidase
IPR000659
29-217
PD006312 ProDom INRA (l'institut national de la recherche agronomique)
CNRS (centre national de la recherche scientifique)
Тулуза,
Франция
Pyd_amn-
ph_oxd
IPR000659
3-217
PIRSF
000190
Pir (iProClass) Georgetown University Medical Center (GUMC) Вашингтон,
США
PYRIDOX_
OXIDASE
IPR000659
187-200
PS01064 PROSITE
Database of protein families and domains
Swiss Institute of Bioinformatics (SIB) Швейцария,
Женева
Pyridox_
oxidase
IPR000659
3-217
PTHR10851 PANTHER (Protein ANalysis THrough Evolutionary Relationships) Classification System Applied biosystems Форстер,
США
pdxH IPR000659
1-217
TIGR00558 TIGRFAMs
tigr protein families
TIGR (The Institute for Genomic Research) Роквилль,
Вашингтон, США
FMN_
binding
IPR009002
23-217
SSF50475 Superfamily
HMM library and genome assignments server
MRC Laboratory of Molecular Biology
Stanford University
Кембридж, Англия
Стрэнфорд, США
Pyridox_
oxidase
IPR011576
38-124
PF01243 Pfam
Protein families database of alignments and HMMs
Wellcome Trust Sanger Institute Кингстон,
Кембридж, Англия
PNPOx_
FMN_bind
IPR012349
19-217
G3D.2.30.
110.10
CATH (Gene3D Domain Description Library) BSM Group
Ludwig Institute for Cancer Research Joint NMR Laboratory
Лондон,
Англия