НА ГЛАВНУЮ

Работа с банком EMBL

Описание последовательностей, кодирующих белок
пиридоксамин-5'-фосфатоксидазу

Из документа SwissProt с AC P28225 были взяты две ссылки на банк EMBL
и получены записи, соответствующие этим ссылкам.

Записи EMBL, описывающие последовательности,
кодирующие белок Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase

  I
M92351
II
D90807
ID ECTYSPDH ECD807
AC M92351 D90807
AB001340
Тип молекулы (ДНК/РНК) Геномная ДНК Геномная ДНК
Длина посл-ти в записи 1142 пар оснований 20231 пар оснований
Раздел банка PRO PRO
Начало гена в записи 310 14957
Конец гена в записи 966 15610
Направление гена Прямое Обратное
Дата последнего
изменения документа
17-APR-2005 17-APR-2005

Из записей EMBL были извлечены последовательности, кодирующие белок.
Различие между ними оказалось только в наличии старт-кодона (идентичность:
654/657 (99.5%)), но последовательность одинаковая: в одном случае первый
нуклеотид гена указывается как начало старт-кодона, а во втором случае как
первый нуклеотид следующего за ним кодона.
И неудивительно: обе последовательности из одного организма E. Coli K12.

Схема экзон-интронной структуры человеческого гена G8

Здесь приведена схема гена G8 по данным документа EMBL
с идентификационным номером BA000025:

  --<-[104348...104468]--...--[106575...106681]---