На данной страничке представлена модель молекулы Carbonic anhydrase 2 человека (6WQ5). Для начала работы скрипта жмите "Start script", для продолжения работы - "Resume". Скрипт Вы можете увидеть по следующей ссылке: Скрипт
| Имена атомов | Длина связи (Å) | Угол N-H-O (градусы) |
|---|---|---|
| Альфа-спирали | ||
| O(220SER) - N(224LEU) | 2.84 | 160.4 |
| O(222GLN) - N(225LYS) | 3.12 | 132.9 |
| O(223VAL) - N(227ARG) | 3.21 | 143.9 |
| Бета-тяжи | ||
| O(123THR) - N(89ARG) | 2.83 | 151.9 |
| O(119 HIS) - N(94HIS) | 3.06 | 150.6 |
| O(117GLU) - N(96HIS) | 2.89 | 151.8 |
Таблица 1 Параметры водородных связей между остовными атомами во вторичной структуре
По результатам измерений, средняя длина водородной связи между остовными атомами водорода и кислорода в альфа - спирали составила около 3,05 Å, в бета - листе - около 2,93 Å. Угол N-H-O в альфа - спирали равен 145.7 градусов, в бета - листе - около 151,4. Средняя длина водородных связей по белку - 2,99 Å, средняя величина угла - 155,95 градусов.
В целом, полученные результаты совпадают с данными литературы. Стандартная длина водородных связей составляет около 2,7-3,0 Å [1], что сходно со средней длиной связей в белке. Другие источники говорят о том, что угол N-H-O должен быть равен примерно 180 градусам [2], что тоже соотносится с результатами исследования.