Overlap area in Angstrom^2 between polygons defined by atoms on successive
bases. Polygons projected in the mean plane of the designed base-pair step.

Values in parentheses measure the overlap of base ring atoms only. Those
outside parentheses include exocyclic atoms on the ring. Intra- and
inter-strand overlap is designated according to the following diagram:

                    i2  3'      5' j2
                       /|\      |
                        |       |
               Strand I |       | II
                        |       |
                        |       |
                        |      \|/
                    i1  5'      3' j1

     step      i1-i2        i1-j2        j1-i2        j1-j2        sum
   1 GG/CC  4.12( 2.60)  0.00( 0.00)  0.34( 0.00)  0.33( 0.00)  4.80( 2.60)
   2 GG/CC  3.92( 2.59)  0.00( 0.00)  0.60( 0.00)  0.00( 0.00)  4.53( 2.59)
   3 GG/CC  4.29( 2.56)  0.00( 0.00)  0.80( 0.00)  0.00( 0.00)  5.09( 2.56)
   4 GU/AC  6.22( 3.44)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  4.03( 2.48) 10.26( 5.92)
   5 UA/UA  0.61( 0.00)  0.00( 0.00)  1.70( 1.25)  0.15( 0.00)  2.46( 1.25)
   6 AC/GU  2.31( 0.99)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  5.81( 2.88)  8.13( 3.87)
   7 CG/CG  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  5.24( 2.40)  0.01( 0.00)  5.25( 2.40)
   8 GA/UC  4.16( 1.64)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  3.01( 0.29)  7.17( 1.93)
   9 AG/CU  2.75( 2.56)  0.00( 0.00)  0.95( 0.00)  0.00( 0.00)  3.70( 2.56)
  10 GG/CC  4.24( 2.08)  0.00( 0.00)  1.02( 0.00)  0.00( 0.00)  5.26( 2.08)
  11 GU/AC  6.53( 3.69)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  3.76( 1.46) 10.29( 5.15)
  12 UU/GA  4.28( 2.20)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  4.16( 2.60)  8.44( 4.80)
  13 UA/UG  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)
  14 AU/UU  5.02( 1.09)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  4.28( 2.23)  9.29( 3.32)
  15 UU/AU  3.00( 1.40)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  5.53( 4.26)  8.53( 5.66)
  16 UC/GA  3.01( 1.03)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  2.63( 1.16)  5.64( 2.19)
  17 CC/GG  1.12( 0.00)  0.00( 0.00)  0.19( 0.00)  3.42( 1.98)  4.74( 1.99)
  18 CG/CG  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  5.07( 2.28)  0.00( 0.00)  5.07( 2.28)
  19 GG/CC  3.63( 2.28)  0.00( 0.00)  0.54( 0.00)  0.00( 0.00)  4.17( 2.28)
  20 GC/AC  5.97( 3.57)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  5.55( 3.05) 11.52( 6.62)
  21 CG/CA  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.18( 0.00)  1.35( 0.72)  1.53( 0.72)
  22 GC/GC  4.56( 1.74)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  6.96( 3.74) 11.52( 5.47)
  23 CC/GG  0.05( 0.00)  0.00( 0.00)  0.79( 0.00)  2.83( 1.31)  3.68( 1.31)
  24 CA/AG  2.36( 1.06)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  2.36( 1.06)
  25 AA/UA  0.00( 0.00)  1.80( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  1.80( 0.00)
  26 AG/CU  2.72( 1.04)  0.00( 0.00)  0.10( 0.00)  0.00( 0.00)  2.82( 1.04)
  27 GG/CC  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)
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